Regent Instruments - Technical Support
Analyse d'Images pour la Science des Plantes
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Regent Instruments Inc. depuis 1991

 

 


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Soutien technique

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Le soutien technique est disponible par e-mail pour les clients enregistrés.

Vous pouvez nous contacter par e-mail à l'adresse indiquée aux endroits suivants :

1) Dans l'écran d'accueil qui s'affiche à chaque lancement de l'un de nos logiciels ; 
2) Dans les manuels d'instructions de nos produits : a) sur la page de garde, b) sur la page 1 et c) dans la section Annexe FAQ

Nous répondons généralement dans un délai d'une heure aux messages reçus pendant nos heures de travail. Si cela prend plus de temps, cela peut être dû à un volume d'e-mails plus élevé que d'habitude, à des vacances ou à l'été lorsque nous avons du personnel en vacances.

 
Veuillez nous fournir les informations suivantes lorsque vous nous contactez;
  • Le nom et la version du logiciel (c'est-à-dire WinRHIZOPro 2021a) avec lequel vous travaillez, le nom du produit (c'est-à-dire le scanner STD4800) et le numéro de client sur votre clé de protection. Ces informations nous permettent de répondre plus efficacement et plus rapidement.
FAQs
1. Compatibilité Windows 7 à 11
2. La clé de protection n'est pas trouvée par le logiciel
3. Comment procéder à une première installation, une mise à jour ou une mise à niveau?
4. Quelle est la meilleure façon d'apprendre à utiliser les logiciels de Regent
5. ijl15.dll n'est pas trouvé par le logiciel.
6. Compatibilité des systèmes d'exploitation logiciels 32 et 64 bits
7. Raisons de passer à une version logicielle 64 bits
8. Computer Specifications
9. Problèmes de scanners
10. Communs à tous nos logiciels
11. WinCELL
12. WinDENDRO
13. WinRHIZO
14. WinRHIZO TRON
15. WinSEEDLE
16. WinFOLIA
17. WinSCANOPY
1. Compatibilité Windows 7 à 11

Tous nos logiciels fonctionnent sous Windows 7 à 11 (32 & 64 bits). Si votre clé de protection est noire oumauve, vous devez installer les pilotes de la clé version 7.6.8 avant de connecter la clé. Vous pouvez télécharger le fichier du pilote 7.6.8 en cliquant ici..

Note pour Windows 11: Si la clé de protection ne fonctionne pas (i.e. vous obtenez le message "Protection Key not found"), vous devrez alors mettre à off (désactiver) "Memory Integrity" ("Intégrité de la mémoire) dans les paramètres (settings) de Windows. Une autre solution est de mettre à jour votre logiciel (ils utilisent des clés de protection sans pilotes (drivers)).

2. Clé de protection introuvable

Le message suivant s'affiche lorsque vous essayez de numériser ou de charger une image:

Clé de protection introuvable. Veuillez vérifier son installation.

Cela signifie que notre logiciel ne peut pas localiser la clé matérielle de protection nécessaire à son bon fonctionnement. Il doit être connecté à l'ordinateur sur lequel le logiciel est exécuté.

  1. La clé peut être l'un des 4 modèles: 3 modèles USB sont illustrés ci-dessous. Si vous possédez une clé beige avec port parallèle, elle ne peut pas être exécutée sous Windows 10 et 11 (votre seule option est de mettre à jour votre logiciel).
    KeyCyan

    Clé de protection Cyan

    Aucune installatin de pilote requise

    Clé de protection Noire

    Vous devez installer le pilote 7.6.8

    Clé de protection Mauve

    Vous devez installer le pilote 7.6.8

    Vous pouvez télécharger le fichier du pilote 7.6.8 en cliquant ici.
  2. Il y a plusieurs raisons pour lesquelles le logiciel pourrait ne pas être en mesure de trouver la clé. Voici quelques éléments à vérifier ou à faire:

    1) Les pilotes doivent être installés avant de connecter la clé. Si ce n'est pas le cas ou si vous n'êtes pas sûr, essayez de le désinstaller (en utilisant le même logiciel que pour l'installation), de redémarrer l'ordinateur, de réinstaller les pilotes (essayez avec les paramètres par défaut), de redémarrer l'ordinateur puis de connecter la clé.

    2) Assurez-vous que la clé est connectée directement à l'un des ports USB de l'ordinateur (et non via un concentrateur USB, un moniteur ou autre).

    3) Assurez-vous que vous utilisez la bonne clé pour le logiciel. Vérifiez que le modèle logiciel écrit sur la clé est le même que le modèle logiciel que vous essayez d'utiliser (écrit dans son écran d'accueil au démarrage).

    Si ces suggestions ne fonctionnent pas, contactez le soutien technique.

3. Comment installer, mettre à jour ou mettre à niveau nos logiciels?
  1. Pour les logiciels avec la clé de protection cyan (voir photos ci-dessus) : Nos logiciels sont stockés sur la clé avec ses manuels d'instructions (en pdf) et des images démo. Copiez-les simplement sur le bureau de votre ordinateur. Double-cliquez sur l'icône du logiciel pour le démarrer (WinDENDRO.exe, WinRHIZO.exe...).    
  2. Pour les logiciels avec une ancienne clé de protection mauve ou noire : Ces logiciels sont fournis sur un CD ou un DVD étiqueté avec le nom du produit et sa version (par exemple WinDENDRO Reg 2016a). Copiez simplement son contenu sur le bureau de votre ordinateur. Notez que si vous travaillez avec Windows 10 ou 11, vous devez installer les pilotes de clé version 7.6.8 que vous pouvez obtenir ci-dessus dans "CLE DE PROTECTION" plutôt que la version sur le CD/DVD. Double-cliquez sur l'icône du logiciel pour le démarrer (WinDENDRO.exe, WinRHIZO.exe...). Remarque: si vous avez perdu le CD, vous pouvez également copier les fichiers depuis n'importe quel ordinateur ou sauvegarde qui en possède. Si votre logiciel n'est pas trop vieux, nous pouvons également produire un remplacement sur support USB ou un lien de téléchargement personnalisé moyennant des frais (contactez notre département des ventes pour plus de détails).
  3. Pour les logiciels avec clé de protection beige avec port parallèle: elle ne peut pas fonctionner sous Windows 10 et 11, vous devez mettre à jour votre logiciel.
4. Quelle est la meilleure façon d'apprendre à utiliser les logiciels de Regent ?

La seule façon est de lire le(s) chapitre(s) d' introduction de son manuel d'instructions et d'essayer les exemples avec nos images de démonstration. Ces images sont faciles à analyser et montrent des applications typiques. Pour WinRHIZO et WinSEEDLE, consultez également le didacticiel vidéo fourni avec ces produits (il montre comment installer le matériel, numériser et analyser un échantillon).

 
5. Le fichier ijl15.dll n'est pas trouvé par le logiciel.

Au démarrage d'un de nos logiciels, le message suivant apparaît:

L'exécution du code ne peut pas continuer car ijl15.dll est introuvable. La réinstallation du logiciel peut résoudre ce problème.

Cela signifie que ijl15.dll est introuvable sur votre ordinateur. Téléchargez le fichier en cliquant ici. Après le téléchargement, décompressez-le et déplacez-le dans le dossier du logiciel à côté de son fichier .exe (WinDENDRO.exe, WinRHIZO.exe...)

6. Compatibilité des logiciels et des systèmes d'exploitation 32 et 64 bits

Toutes les versions 32 bits de nos logiciels fonctionnent sur des ordinateurs avec des versions de système d'exploitation Windows 32 bits ou 64 bits (Windows 7 à 11). 

Toutes les versions 64 bits de nos logiciels fonctionnent UNIQUEMENT sur les ordinateurs avec la version 64 bits du système d'exploitation Windows (Windows 7 à 11).

7. Raisons de passer à une version logicielle 64-bit
Nos logiciels 64 bits ont les mêmes caractéristiques et fonctionnalités que leurs versions 32 bits, sauf :

  1. Ils peuvent charger et analyser des images beaucoup plus grandes.    
  2. Ils sont environ 15% plus rapides.
  3. Malheureusement, ils ne peuvent acquérir des images que via des pilotes TWAIN64 et ceux-ci sont rares (à partir de novembre 2021, nos STD4800 n'ont pas de tels pilotes, mais notre troisième génération LA2400 en a). Lorsqu'il n'y a pas de tels pilotes, la seule option consiste à acquérir des images avec le logiciel du fabricant du scanner, à enregistrer les images et à les charger dans nos logiciels pour analyse.
8. Spécifications de l'ordinateur
L'analyse d'images est très gourmande en ressources informatiques. Vous trouverez ci-dessous les modèles idéaux (en date de novembre 2021), ceux qui rendront votre travail agréable et efficace. Il peut toujours fonctionner sur des ordinateurs moins puissants, mais les analyses seront plus lentes, vous devrez peut-être réduire la taille de l'image et certaines fonctionnalités du logiciel pourraient ne pas être disponibles.

  1. Processeur:  Cet élément est important. Un équivalent Intel Core i7, i9, Xeon ou AMD est recommandé car ces processeurs sont mieux adaptés au multimédia. Un processeur plus rapide est meilleur. 16 cœurs est idéal car il donne une accélération de la vitesse à tous nos logiciels sauf deux.    
  2. RAM:  32 Go ou plus et rapides (2800, 3200 MHz). Le quadri-canal est plus rapide (pour le bureau principalement). Remarque: Seules les versions 64 bits de nos logiciels peuvent utiliser toute cette mémoire. Toutes les applications 32 bits sont limitées à 2 Go. Plus il y a de mémoire, plus les grosses images peuvent être analysées et des analyses plus complexes peuvent être effectuées. 
  3. Système d'exploitation (OS): Windows 7, 10 ou 11. Tous nos logiciels 32 bits peuvent fonctionner sur les systèmes d'exploitation Windows 32 et 64 bits. Nos logiciels 64 bits ne peuvent fonctionner que sous le système d'exploitation Windows 64 bits.    
  4. Un disque dur rapide: le SSD est le meilleur et fait une différence de vitesse lors du stockage ou de la récupération des images.
  5. Un graveur de DVD ou un serveur à distance pour le stockage d'images à long terme (si vous souhaitez stocker les images).    
  6. Un grand écran. 27" ou plus c'est bien. Plus la taille de l'écran augmente, moins il faut de défilement (gain de productivité) et ce dernier a une meilleure vision globale des images et de leurs mesures.
  7. Carte vidéo : Pas besoin de cartes vidéo haut de gamme, 3D ou accélérées pour les jeux vidéo. Nos logiciels ne sont pas intensifs en vidéo. Une carte vidéo discrète vaut la peine d'être payée (elle possède sa propre mémoire) bien qu'il existe maintenant quelques bonnes cartes vidéo intégrées récentes.

9. Problèmes de Scanners
  1. La zone de numérisation du scanner LA2400 de 3e génération est décalée. Si vous utilisez les logiciels Regent version 2021 et antérieure, vous devez installer le pilote TWAIN version 6.2 fourni avec votre scanner (sur un CD ou sur la clé de nos produits) et non celui d'Internet. Si vous utilisez les versions 2022 ou plus, vous devez installer la version 6.5 ou plus (prenez-la de notre clé de produits, elle a été testée pour fonctionner avec notre logiciel.
  2. Compatibilité des versions 32 ou 64 bits du logiciel Regent avec les scanners:  Si vous avez reçu à la fois les versions 32 et 64 bits de nos logiciels, il est préférable d'utiliser la version 64 bits car elle est plus rapide (10 à 40 %) et peut analyser des images plus grandes. Il y a des cas où la version 32 bits doit être utilisée et la version 64 bits ne peut pas: Lors de l'acquisition d'images directement à partir de nos logiciels avec nos scanners STD4800, LC4800 et bien d'autres sur le marché. Ces scanners ne disposent pas du pilote TWAIN 64 bits requis. Par conséquent, la version 64 bits ne peut pas acquérir d'images directement à partir de ceux-ci. Depuis juillet 2022, seul notre scanner LA2400 de troisième génération dispose de ce pilote 64 bits. Ce scanner permet d'acquérir des images à partir des versions 32 et 64 bits de nos logiciels.
  3. Bandes verticales dans les images et/ou temps de numérisation extrêmement lent et/ou l'image est surexposée (très lumineuse):  cela peut se produire lors de la numérisation avec la lumière TPU (généralement en niveaux de gris) et qu'il y a un objet (racines, cadre, plateau , poussière....) est présent dans la zone de calibrationde la fente du TPU (les premiers 1,8 cm de la zone de la vitre de numérisation près de l'origine, le côté où la tête de numérisation est garée). Assurez-vous qu'il n'y a pas d'objets à cet endroit et nettoyez de temps en temps cette zone et la vitre de protection en TPU. Si ce(s) problème(s) se produisent avec la lumière réfléchissante (généralement dans les numérisations couleur), il peut y avoir de la poussière ou d'autres débris sous la vitre de numérisation. Cela peut parfois être corrigé par l'utilisateur (contactez-nous pour plus de détails).
  4. Le scanner fait du bruit lorsqu'il est sous tension et le voyant rouge à l'avant clignote.
    Vérifiez que le scanner et le TPU (le couvercle du scanner) sont déverrouillés. Il y a un verrou à l'arrière du scanner et sur la face inférieure du TPU. Assurez-vous qu'ils sont en position déverrouillée.
  5. Le scanner indique une erreur lorsqu'il est allumé (le voyant rouge clignote devant le scanner): 

    Selon le modèle de scanner, une erreur est indiquée par les voyants situés devant (généralement une LED rouge clignotante). Reportez-vous au manuel du scanner pour la signification de l'état des voyants et un indice sur la cause potentielle du problème. Si l'erreur persiste, essayez ce qui suit. Débranchez tous les câbles (sauf l'alimentation) et les périphériques connectés au scanner (câble du scanner à l'ordinateur et du scanner au TPU). Allumez le scanneur. S'il indique une erreur, le scanner est probablement endommagé. Si le scanner n'indique pas d'erreur, éteignez-le et connectez l'unité TPU (si vous en avez une). Allumez le scanneur. Si les voyants du scanner indiquent une erreur, le TPU (ou le scanner) est probablement endommagé ou le TPU est toujours verrouillé. Si c'était le cas, déverrouillez-le et réessayez la procédure. Si le scanner n'indique pas d'erreur, éteignez-le. Branchez le câble qui le relie à l'ordinateur. Allumez le scanneur. Si cela ne fonctionne pas, le câble est probablement endommagé. Essayez de le remplacer. Si aucune des procédures ci-dessus ne résout le problème, contactez le soutien technique et faites-leur savoir quels tests vous avez effectués et les résultats que vous avez obtenus.

  6. Message "Erreur de communication" lors d'une tentative de numérisation:  ce message signifie que notre logiciel ne peut pas envoyer de commandes au scanner et il peut s'afficher dans les situations suivantes : 1) Si le scanner n'est pas sous tension et bien connecté à l'ordinateur ou si le câble est endommagé, 2) lorsque vous avez deux ou plusieurs instances de WinRHIZO en cours d'exécution (la première peut communiquer mais pas les autres) et 3) une erreur ou un crash s'est produit lors de l'utilisation du scanner. Pour résoudre ce problème, éteignez puis rallumez le scanner et redémarrez l'ordinateur (cela réinitialisera les pilotes TWAIN).
  7. "Le couvercle de l'ADF ou de l'ADF est ouvert. Fermez-le et rechargez les originaux" Message d'erreur lors d'une tentative de numérisation avec TPU (scanner LA uniquement):  ce message signifie que le velcro entre les charnières en TPU à l'arrière du scanner n'est pas à la bonne position. Assurez-vous qu'il est en position "Avec bacs" et qu'il appuie sur la broche noire sur le dessus du scanner.

    Si votre scanner a été acheté après mai 2024, il est livré avec un nouveau kit Velcro plus simple. Celui-ci est constitué d'une seule bande Velcro à installer au dos du scanner. Deux disques Velcro ronds mâles sont fixés sur la surface du scanner sur deux côtés différents de la tige noire qui sort du scanner. La bande Velcro femelle doit reposer sur ces deux disques en appuyant sur la tige noire pour la maintenir enfoncée. Il doit être installé si vous numérisez avec ou sans plateaux (ou espaceurs TPU).
10. Commun à tous nos logiciels

Cette section contient des rubriques d'aide communes à tous nos logiciels.

  1. Windows Defender indique que WinRHIZO32.exe (WinFOLIA32.exe, WinDENDRO32.exe, WinFOLIA32.exe...) est une menace et souhaite le mettre en quarantaine.  Si Windows Defender affiche un message indiquant que l'un de nos logiciels est une menace ou contient un virus (ou quelque chose d'équivalent), dites-lui de lui faire confiance et de ne PAS le mettre en quarantaine (sinon vous le perdrez et ne pourra pas l'exécuter).
  2. Impossible de trouver WinRHIZO32.exe (WinFOLIA32.exe, WinDENDRO32.exe, WinFOLIA32.exe...) sur la clé de protection.  Vérifiez que Windows Defender ne l'est pas supprimé de la clé et ne l'est pas mis en quarantaine. Voir la question précédente de la FAQ (10.1).
  3. Recevoir un message avec un point d'exclamation, qu'est-ce que cela signifie ?  Cela signifie que vous avez atteint la limite de mémoire de nos logiciels 32 bits. Cela arrivera avec des images d'environ 500 Mo (non compressées). Lorsque vous atteignez cette limite, vous pouvez faire plusieurs choses pour la vaincre : 1) Vous pouvez recadrer vos images pour les parties qui ne contiennent pas d'objets à mesurer, 2) numériser en niveaux de gris au lieu de la couleur (images en niveaux de gris consomme quatre fois moins de mémoire que les images couleur pour la même zone de numérisation et le même dpi), 3) réduisez le dpi si cela est acceptable (vous perdez également un peu de précision en le faisant) ou 4) évitez à la version 64 bits. Ce dernier est plus rapide et peut gérer des images beaucoup plus grandes. Les versions 2021b et 2022 ont été testées avec des images d'une taille maximale de 8 Go (mais devraient fonctionner avec des images plus grandes).
  4. Version 32 bits ou 64 bits du logiciel Regent? :  Si vous avez reçu à la fois les versions 32 et 64 bits de nos logiciels, il est préférable d'utiliser la version 64 bits car elle est plus rapide (10 à 40 %) et peut analyser des images plus grandes. Il y a des cas où la version 32 bits doit être utilisée et la version 64 bits ne peut pas : Lors de l'acquisition d'images directement à partir de nos logiciels avec nos scanners STD4800, LC4800 et bien d'autres sur le marché. Ces scanners ne disposent pas du pilote TWAIN 64 bits requis. Par conséquent, la version 64 bits ne peut pas acquérir d'images directement à partir d'eux. Depuis juillet 2022, seul notre scanner LA2400 de troisième génération dispose de ce pilote 64 bits. Ce scanner permet d'acquérir des images à partir des versions 32 et 64 bits de nos logiciels. Notez que les images analysées et enregistrées avec la version 32 bits peuvent être ouvertes avec leur analyse visible en version 64 bits, mais que l'inverse n'est pas vrai.
  5. Limites de mémoire des logiciels 32 bits :  Tous les logiciels 32 bits exécutés sous Windows peuvent accéder jusqu'à 2 Go de mémoire RAM, même si plus cela est installé sur l'ordinateur. Cette mémoire est utilisée par le logiciel lui-même, la ou les images et ses données. Il existe également d'autres pertes qui augmentent après avoir travaillé avec un logiciel pendant un certain temps. Pour nos logiciels 32 bits, la plus grande taille d'image peut être analysée est généralement de 500 Mo (une fois décompressée) et dépend des analyses qui y sont effectuées (l'analyse des couleurs et les filtres de débris consomment beaucoup plus de mémoire , par exemple). Nos logiciels 64 bits, quant à eux, peuvent gérer des images des milliers de fois plus volumineuses. Nous avons testé nos logiciels 64 bits sur des images jusqu'à 8 Go (novembre 2021), ce qui est des images assez volumineuses pour les ordinateurs d'aujourd'hui. Les appareils d'imagerie qui les produisent sont également rares (notre LA2400 3e génération peut produire des images assez grandes avec son pilote TWAIN 64).
  6. Problèmes d'analyse par lots :  Voici quelques éléments à vérifier lorsque l'analyse par lots ne fonctionne pas : 
    a) Les images doivent être transférées sur le disque local de l'ordinateur (comme C :) et non sur un disque ou un serveur loin. 
    b) Les paramètres utilisés pour l'analyseur les images sont corrects. Pour vérifier cela, chargez une image qui ne sera pas analysée par lot et analysez-la de manière interactive (cliquez dessus ou faites une sélection). Regardez si l'image est bien analysée. 
    c) Est-ce qu'il s'arrête ou plante toujours sur la même image ou sur des images différentes ? Si c'est le premier, essayez de le supprimer. Peut-être qu'il a un problème et qu'il est le seul. 
    d) Ty apprécie le nombre d'images dans le dossier (divisé en 2 ou 4). Comme les analyses se font dans le temps, il y a des pertes de mémoire et celles-ci s'ajoutent. Peut-être jusqu'à un point où il n'y a pas assez de mémoire pour analyser d'autres images. 
    e) Assurez-vous que l'analyse que vous effectuerez peut être effectuée par lots. Pour WinRHIZO, cela signifie qu'il ne faut pas tenter d'effectuer une analyse topologique ou de développer car celles-ci reçoivent un clic interactif de l'utilisateur. Pour WinFOLIA, le mode Leaf Morphology à la même exigence. 
    f) Essayez de stocker les images dans un dossier sur le bureau plutôt que dans un dossier renforcé imbriqué dans une hiérarchie de dossiers (chemin court et noms d'image). 
    Si rien de ce qui précède ne fonctionne, il s'agit peut-être d'un bogue dans la version du logiciel. Les versions plus anciennes (10 à 15 ans) sont plus sujettes à de tels problèmes. La mise à jour résoudra très probablement le problème. 
  7. Calibration d'image : Si vous obtenez des mesures en px (pixels), c'est parce que les images ne sont pas calibrées. Les images provenant de scanners n'ont pas besoin d'être calibrées par l'utilisateur. Ceux des caméras le font toujours (car la taille d'un pixel dépend du FOV de l'objectif et de la distance entre l'objet à mesurer et la caméra). Pour analyser les images des caméras, vous devez choisir "Echelle dans l'image" (ou "Objet de dimensions connues" pour les anciennes versions) dans Calibration/Méthode de taille de pixel. Lorsque vous êtes prêt à effectuer une calibration, chargez l'image contenant la mire puis activez Calibration/Nouvelle caliration et suivez la procédure indiquée dans le manuel d'instructions pour cette commande. Une fois que vous avez effectué une calibration, il reste effectif pour les images que vous analysez ensuite, jusqu'à ce que vous l'annuliez ou fassiez un autre calibration. Vous pouvez également enregistrer et charger une calibration (Calibration/Load Calibration & Calibration/Save Calibration) pour l'utiliser sur d'autres images.    
  8. La fenêtre principale n'est pas visible : Lorsque cela se produit, relancez le logiciel puis choisissez "Paramètres par défaut" + "Pour le scanner" dans la fenêtre de bienvenue affichée au démarrage. Si votre logiciel est ancien et ne propose pas ce choix, supprimez le fichier WinRHIZO.cfg (WinFOLIA.cfg, WinDENDRO.cfg...) qui se trouve dans le même dossier que WinRHIZO.exe (WinFOLIA.exe, WinDENDRO.exe. . .) et démarrez-le en double-cliquant sur ce dernier.
  9. Lignes de titre manquantes dans le fichier de données :  cela se produit lorsque des personnes enregistrent des données dans un nouveau fichier (un qui n'existe pas) en utilisant la commande de menu "Ouvrir" Données au lieu de "Nouveau". Le premier consiste à ajouter des données d'analyse en cours à un fichier existant (qui a déjà des lignes de titre plus des lignes de données d'analyses précédentes), le second à créer un nouveau fichier (qui sera ajouté des lignes de titre et les données d'analyse en cours). En résumé, utilisez Nouveau lorsque le fichier de données n'existe pas et Ouvrir lorsqu'il existe.    
  10. Problèmes d'ouverture des fichiers .tif . Si notre logiciel est antérieur à 2021, la première a choisi de vérifier est que votre fichier .tif est enregistré au format tiff "non compressé". Il s'agit d'une option permettant de gagner du temps dans la plupart des logiciels. Vérifiez également qu'il s'agit de niveaux de gris 8 bits ou de couleurs 24 bits, rien d'autre. WinDENDRO, contrairement à nos autres logiciels, prend également en charge les niveaux de gris 12 et 16 bits et les images couleur 36 et 48 bits pour les analyses de densité ou de réflectance bleue. Il existe de nombreuses variantes du format de fichier tiff et nos logiciels ne prennent pas toutes en charge (les calques ou les images multi-résolutions en sont des exemples). Si un fichier ne s'ouvre pas, essayez de l'ouvrir dans un logiciel autre que celui utilisé pour le créer et réenregistrez l'image à partir de là. Notez que nos logiciels les plus récents ouvrent plus de formats de fichiers ou de variantes de ceux-ci que les plus anciens.
  11. Problèmes d'ouverture des fichiers .jpg . Depuis novembre 2021, il existe une option non prise en charge par nos logiciels et il s'agit du canal Alpha (images couleur 32 bits). vérifiez-vous qu'ils sont en couleur 24 bits.
  12. Impossible d'ouvrir le logiciel XLRhizo.xlsm, XLFolia.xlsm, XLSeedle.xlsm... obtenu à partir de votre site ou d'un message électronique . Windows peut parfois bloquer ces fichiers lorsqu'ils ont été obtenus sur Internet. Pour débloquer un fichier, faites un clic droit sur le fichier .xlsm puis cliquez sur "Propriétés". Dans l'onglet "Général" de la fenêtre Propriétés, cochez la case "Débloquer" puis cliquez sur "Appliquer". Votre fichier .xlsm devrait maintenant être prêt à être utilisé.
  13. Le menu du complément n'est pas visible dans Excel lors de l'exécution du logiciel XLRhizo.xlsm, XLFolia.xlsm, XLSeedle.xlsm... . Par défaut, le menu Add-In doit être affiché. Si ce n'est pas le cas, vous pouvez allumer son affichage manuellement. Pour cela, allez dans "Fichier/Options" puis allez dans l'onglet "Personnaliser le ruban", et cochez l'option "Compléments" à droite (sous "Personnaliser le ruban".
  14. J'ai perdu mon CD/DVD avec les logiciels de Regent . Nous n'avons pas de site de téléchargement pour nos logiciels. Il y en a trop (produits, modèles, années différentes) et toutes les ventes ne se valent pas (certains achètent des options, d'autres non, le fichier Scanner.cal diffère...). 
    • Vous pouvez trouver notre logiciel de logiciel sur le CD/DVD au dos de son manuel d'instructions. 
    • Vous pouvez également le copier à partir de n'importe quel ordinateur sur lequel ce logiciel est installé ou à partir de toute sauvegarde effectuée puisque vous possédez le logiciel. 
    • Notez que vous pouvez obtenir les pilotes de clé 7.6.8 requis par tous nos logiciels dans cette section FAQ (requis uniquement avec les anciennes clés violettes ou noires). 
    • Si vous n'en avez pas, vous pouvez acheter un kit média de remplacement (si votre logiciel n'est pas trop ancien, généralement 10 ans). Ce support peut être une clé USB envoyée par mail ou un lien de téléchargement Internet personnalisé. Les deux contiendraient une copie de ce que vous avez achetée à l'époque (logiciel(s), manuels, fichier de calibration...). Si vous êtes intéressé, veuillez contacter notre service commercial. Notez que la clé USB mentionnée ici sert uniquement au stockage de logiciels (elle remplace les CD et les DVD), elle ne permet pas d'exécuter nos logiciels. Si vous possédez une clé de port parallèle beige, elle ne peut pas être exécutée sous Windows 10 et 11 (vous devez mettre à jour votre logiciel car nous ne pouvons pas créer de clé USB ou de lien de téléchargement pour celle-ci). 
    • Nous apportons régulièrement des améliorations à nos logiciels. Ceux-ci sont répertoriés dans la page Web "Les plus récents" de chaque produit sur notre site Web. C'est une bonne idée de mettre à jour votre logiciel (plutôt que de payer pour obtenir le même ancien logiciel). Nos nouvelles clés de protection n'ont plus besoin d'installation de pilote et sont également une clé USB sur laquelle nous modifions nos logiciels et manuels au lieu d'un CD/DVD. Si vous êtes intéressé, veuillez contacter notre service commercial.
  15. Le contenu de ma clé cyan a été supprimé (partiellement ou totalement) . C'est l'équivalent de la précédente FAQ (CD ou DVD perdu#12), merci de vous y référer.
  16. Où puis-je trouver les manuels d'instructions des logiciels Regent . Tous nos logiciels sont accompagnés d'un fichier numérique imprimé et pdf Manuels d'instructions. Cette dernière se trouve sur votre ordinateur dans le dossier du logiciel et également sur son CD/DVD (au dos du manuel imprimé) ou dans la zone de stockage de la clé de protection (clé cyan uniquement).
  17. Impossible de modifier l'identification de l'échantillon ou les données dans le fichier de données :  nos logiciels ne peuvent modifier que le contenu du fichier de données pour la région analysée en cours d'analyse (la région active affichée dans la zone d' image de la fenêtre principale), pas celles analysées précédemment. Vous pouvez cependant modifier les données précédemment enregistrées dans un logiciel comme Excel. Faites une sauvegarde de votre fichier avant de le faire, au cas où les choses tourneraient mal. 1) Importez le fichier de données .txt dans Excel (voir l'annexe A du manuel d'instructions du logiciel), 2) Éditez les cellules de données que vous souhaitez modifier et 3) Enregistrez le fichier de données en tant que .txt .
  18. Les commandes du menu "Couleur" ne sont pas actives, pourquoi ? :  Les commandes du menu Couleur ne sont disponibles que dans certains logiciels Regent (WinRHIZO Pro & Arabidopsis, WinFOLIA Pro, WinSEEDLE Pro, WinCAM Reg et Pro, WinCELL Pro & WinSCANOPY Pro). 
    Ces commandes ne sont actives que lorsque "Analyse des couleurs" est active. Pour l'activer : 
    dans WinRHIZO : Sélectionnez "Couleur" à droite de "Détection de racine basée sur". 
    dans WinFOLIA : Sélectionnez "Couleur" à droite de "Détection de feuilles basées sur" 
    dans WinSEEDLE : Sélectionnez "Couleur" à droite de "Détection de semis basées sur" 
    dans WinCAM : Sélectionnez "Couleur" à droite de "Détection d'objet basé sur" sur " dans WinCELL : sélectionner
    "Couleur" à droite de "Détection de cellule basée sur" 
    dans WinSCANOPY : sélectionnez "Couleur" à droite de "Détection de canopée basée sur" 
    (pas une image en niveaux de gris).
  19. Quand et comment utiliser le Fond Bleu de Regent:  Le fond bleu est fourni pour l'analyse des couleurs avec certains de nos logiciels (voir la liste ci-dessous). Il est bien adapté pour analyseur tous les objets qui n'ont pas la couleur bleue dessus (racines, feuilles, graines, fruits, légumes...). 
    1) placez l'objet à numériser sur la vitre du scanner et le fond bleu derrière. 
    2) Dans Image/Acquisition Parameters choisissez "Color" à droite de "Image type" et pour WinCAM & WinFOLIA choisissez la source lumineuse "Reflective". Pour WinRHIZO et WinSEEDLE, cette lumière est sélectionnée par défaut lorsque vous choisissez le type d'image "Couleur". 
    3) Dans « Root (Leaf, Seedle or Object) & Background Detection », activez l'analyse des couleurs en procédant « Color » à droite de « Object detection based on ». Vous êtes maintenant prêt à 
    numériser et analyser vos échantillons en couleur. Pour en savoir plus Pour plus de détails, veuillez vous référer au manuel d'installation et d'utilisation du "Scanner STD4800 (ou LA2400) pour WinRHIZO (WinFOLIA, WinSEEDLE, WinCAM...)". Vous avez reçu une copie imprimée avec votre scanner et une version pdf sur la clé de protection logicielle de Regent. Une fois notre logiciel est installé sur votre ordinateur, vous en avez également une copie dans son dossier (par exemple "WinRHIZO Pro 2022 10 juillet 2023"). 
    Le fond bleu ne doit pas être utilisé pour l'analyse des niveaux de gris (ou des images en niveaux de gris ou lorsque "Analyse des couleurs" n'est pas actif). 
    logiciels logiciels de Regent qui ont une analyse des couleurs : WinRHIZO Pro et Arabidopsis, WinFOLIA Pro, WinSEEDLE Pro, WinCAM Reg et Pro, WinCELL Pro et WinSCANOPY Pro.
  20. Charger la configuration ne fonctionne pas (Versions 2021 a et b) . Nous venons de trouver ce bogue, il a été corrigé pour WinRHIZO (contactez-nous simplement pour obtenir la version 2021c). Pour les autres logiciels, jusqu'à ce que nous les corrigions, il existe une solution de contournement. L'ordre des étapes ci-dessous est important. 1) Démarrez le logiciel, 2) Activez Misc/Load Configuration. Sélectionnez votre fichier cfg qui vous intéresse. 3) Activez Fenêtre/Nouveau. Vous avez maintenant deux fenêtres principales. 4) Fermez celui dont le nom se termine par "1" (cliquez sur son coin rouge en haut à droite). Vous n'avez maintenant que la deuxième fenêtre (le nom se termine par 2) qui contient les paramètres du fichier cfg.

 

11. WinCELL

Cette section contient des rubriques d'aide relatives à WinCELL.

  1. Microscope et préparation d'échantillons :  WinCELL peut être utilisé avec de nombreuses marques de microscopes, des modèles bon marché aux modèles haut de gamme. Ce qui est important, c'est qu'il dispose d'un tube sur lequel vous pouvez monter la caméra (via un adaptateur de monture C vendu par le fabricant du microscope) ou qu'il peut produire des images numériques à partir du matériel de son fabricant. 
    WinCELL fonctionne avec des tranches de bois préparées au microtome. Les coupes traversées par la lumière présentent un très bon contraste entre la lumière cellulaire et les parois (ceci est requis par WinCELL). Certaines personnes ont développé des méthodes pour améliorer directement le contraste des cellules avec les murs sur des morceaux de bois afin que les images puissent être prises avec un appareil photo et un objectif ou un scanner (pour les cellules plus grandes). Nous n'avons aucune information sur la manière dont ils procèdent. Si vous obtenez ces bons contrastes, alors WinCELL peut être utilisé sur de tels échantillons. Vous pouvez nous envoyer une image pour déterminer si WinCELL peut les analyser.

 

12. WinDENDRO

Cette section contient des rubriques d'aide relatives à WinDENDRO.

  1. Cernes étroits, contrastes d'échantillons et essences de bois :  WinDENDRO est un système semi-automatique. Lorsque les échantillons de bois sont faciles à analyser (résineux), le gain de productivité par rapport à un système manuel est bon et facilement mesurable. Avec les espèces à feuilles caduques, le gain est moindre (l'opérateur doit annuler de nombreuses décisions prises par le système) et peut être proche de zéro. WinDENDRO n'est pas commercialisé comme un système de vitesse. Il séduit par son approche différente des systèmes manuels. Il permet de travailler sur des images fournies par exemple. Vous pouvez aller et venir pendant que vous mesurez. Il compare la largeur des cernes sur différents rayons pendant que vous effectuez les mesures. Il possède de nombreuses fonctionnalités qu'un système manuel n'a pas. Si un cerne est étroit (0,01 mm) et bien contrasté, il peut être mesuré avec nos scanners. Dès que le contraste est réduit, le nombre de cernes analysables par mm diminue également car il faut plus de pixels pour identifier ce qu'est un cerne. En règle générale, si l'opérateur ne peut pas identifier les cernes dans l'image, l'automatisme ne le fera pas non plus. Vous pouvez alors utiliser le mode manuel de WinDENDRO.
  2. Préparation de l'échantillon : La préparation de la surface dépend de la plus petite largeur de cerne que vous devez mesurer. Une largeur du cerne de 0,01 mm nécessite un ponçage extrêmement fin ou l'équivalent. Une largeur du cerne de 1 cm peut être mesurée sur une surface plus rugueuse. Il y a un compromis entre le temps consacré à la préparation et le temps consacré à l'analyse par la suite. Plus la surface est bonne, plus WinDENDRO trouvera automatiquement de cernes, donc vous aurez moins de corrections à faire.  
  3. Longues carottes ou grands disques :  les échantillons longs ne sont pas faciles à mesurer. Notre plus grand scanner peut acquérir des images de +-43 cm (18") de long. Des carottes plus longues que cela peuvent être numérisées dans deux images ou plus et recousues ensemble dans d'autres logiciels (non inclus). Une haute résolution (50 - 100MP ou plus) la caméra peut également être utilisée.
  4. La méthode de réflexion bleue dans WinDENDRO : La méthode de réflexion bleue est un substitut de l'analyse de densité. Il a été implémenté dans WinDENDRO sur la base de publications scientifiques. Dans la version 2012, nous avons ajouté des commandes et des simplifications afin qu'il puisse être utilisé plus facilement. Notre propre cible de calibration de réflectance bleue (qui doit être scannée avec chaque échantillon) vous permet d'effectuer très facilement des mesures de réflectance (WinDENDRO lit automatiquement les données de calibration de la cible qui l'accompagnent). Vous devez cliquer manuellement sur la cible des étapes dans l'image (ou simplement sur la première et la dernière) et après vous pouvez obtenir des données de réflectance de vos échantillons en traçant des chemins de cernes sur eux (comme vous le faites pour l'analyse de la largeur des cernes). Notez qu'il ne corrèle pas la réflectance aux données de densité en fonction des espèces ou des sites (ou ne fournit pas d'échantillons de densité connus). Il existe des publications scientifiques consacrées à ce sujet. Notez que la méthode de réflectance bleue consomme beaucoup de mémoire (voir le paragraphe 7 ci-dessous).  
  5. Analyse de densité dans WinDENDRO : Vous pouvez effectuer des analyses de densité annulaire avec la version WinDENDRO Densité plus notre scanner SLS light pour les films radiographiques. Nous ne vendons cependant pas : 1) L'équipement pour produire le film radiographique (chambre d'irradiation, équipement de développement, film...) et 2) L'équipement pour concevoir les carottes ou les disques. Le logiciel de densité WinDENDRO peut également mesurer la densité des cernes à partir des images produites par les caméras à rayons X sans film (comme le système ITRAX).
  6. Recevoir un message avec un point d'exclamation, qu'est-ce que cela signifie ?  Cela signifie que vous avez atteint la limite de mémoire de WinDENDRO 32 bits. Cela arrivera avec des images d'environ 500 Mo (non compressées). Voir le paragraphe suivant pour les choses que vous pouvez faire lorsque vous avez atteint cette limite.
  7. Limites de mémoire de WinDENDRO 32 bits . WinDENDRO 32 bits est limité à une taille d'image d'environ 300 Mo (non compressée). Lorsque vous atteignez cette limite, vous pouvez faire plusieurs choses pour la vaincre : 1) Vous pouvez recadrer vos images pour les parties qui n'ont pas de cernes à mesurer, 2) numériser en niveaux de gris au lieu de couleur (images en niveaux de gris consomme quatre fois moins de mémoire que les images couleur pour la même zone de numérisation et le même dpi), 3) réduisez le dpi si cela est acceptable (vous perdez également un peu de précision en le faisant) ou 4) évitez à la version 64 bits. Ce dernier est plus rapide et peut gérer des images beaucoup plus grandes. La version 2021b a été testée avec des images d'une taille maximale de 8 Go (mais devrait fonctionner avec des images plus grandes).
  8. Charger la configuration ne fonctionne pas (WinDENDRO 2021 uniquement) . Nous venons de trouver ce bogue, nous le corrigerons bientôt. En attendant, il existe une solution de contournement. L'ordre des étapes ci-dessous est important. 1) Démarrez WinDENDRO. 2) Activez Divers/Charger la configuration. Sélectionnez votre fichier d'intérêt. 3) Activez Fenêtre/Nouveau. Vous avez maintenant deux fenêtres principales (WinDENDRO1 et WinDENDRO2). 4) Fermez WinDENDRO1 (cliquez sur son coin rouge en haut à droite). Vous n'avez maintenant que WinDENDRO2 qui a les paramètres du fichier cfg.
  9. Pouvons-nous faire du crossdating et de la dissociation de la tendance dans WinDENDRO? WinDENDRO n'est pas un programme de crossdating, c'est pour la mesure des cernes des arbres. Il possède cependant quelques fonctions de base de datation croisée, de dissociation de tendance et spline de lissage, afin que vous puissiez comparer visuellement l'échantillon mesuré et/ou la série de cernes (voir le graphique des largeurs de cernes et la datation croisée, chapitre 5 du manuel de WinDENDRO). Nous appelons ces dernières séries de référence et celles-ci sont stockées dans .fichiers ref2 qui peuvent être créés dans WinDENDRO à partir d'un ou plusieurs échantillons mesurés (chemins de cernes). Les séries de référence tiennent compte du nombre de séries qui les composent, elles ont donc un poids proportionnel dans les calculs. WinDENDRO peut afficher les largeurs de leurs cernes côte à côte et vous pouvez les décaler dans le temps, ajouter ou supprimer des cernes pour voir si cela améliore la datation. Il affiche également un coefficient de corrélation appelé test du signe Gleichlaufigkeit.

    Le crossdating (dissociation de la tendance et spline de lissage) est généralement réalisé dans des programmes dédiés à cela et il en existe des gratuits (Cofecha...). Ils travaillent généralement avec des fichiers au format décennal (Tucson)Les fichiers de données .txt de WinDENDRO peuvent être convertis en fichiers décennaux avec une commande de menu de WinDENDRO (ou pour les anciennes versions à l'aide du programme utilitaire convert.exe fourni avec WinDENDRO)..

 

13. WinRHIZO

Cette section contient des rubriques d'aide relatives à WinRHIZO.

  1. Pourquoi y at-il des classes vides (bacs) dans l'histogramme de distribution des racines ? Ceci est lié à la taille des pixels de l'image et au fait que les diamètres des racines sont mesurés comme un multiple de celui-ci. Tout au long de la racine, son diamètre est mesuré et peut faire 1, 2, 3... ou N pixels de large. Si la taille du pixel est de 0,15 mm, la racine peut mesurer 1x0,15 (=0,15), 2*0,15 (=0,30), 3*0,15 (=0,45). ...N*0,15 mm de large. Donc, selon la façon dont vos classes sont divisées, il est possible que certaines n'y obtiennent jamais de racine (si vos classes sont 0.0 =to< 0.10 =to< 0.20 =to< 0.30 =to< 0.40 par exemple le premier et le troisième serait toujours zéro). Comment minimiser cela ? 1) Activez "Interpolation des pixels" dans Analyse/Mesures. Notez que cela ne fonctionne qu'avec les images en NIVEAUX DE GRIS. Lorsqu'il est actif, WinRHIZO interpole la position du bord racine à une fraction de pixel. Ainsi, le diamètre peut être de 2,24 pixels de large (au lieu de 2 ou 3) par exemple. 2) Définir le mode de mesure du diamètre de la racine sur plus précisément. Dans Analyse/Mesures, à côté de Précision, Plus choisir ou Maximum. 3) Modifiez vos classes de diamètres.   
  2. Pourquoi certaines sommes de données de classe de diamètre ne sont pas égales à des valeurs totales :  WinRHIZO produit deux données de volume (et de surface), une mesurée (plus précise) et une estimée. Le volume racinaire est calculé à partir du diamètre moyen indiqué de la racine calculée à partir de la surface et de la longueur projetée de la racine mesurée (à l'aide de formules trigonométriques en supposant que les racines sont cylindriques). Le volume racinaire mesuré est la somme de tous les volumes calculés le long de la longueur racinaire en utilisant le diamètre mesuré à ces points. Pour une comparaison des deux méthodes de mesure du volume, reportez-vous à la publication ci-dessous. Essentiellement, cela montre que la précision du volume diminue lorsque les variations de diamètre de l'échantillon de racine augmentent.

    Rose L. (2017) Pièges dans les calculs de traits racinaires : comment ignorer l'hétérogénéité du diamètre peut conduire à une surestimation des traits fonctionnels. Frontiers in Plant Science, volume 8, article 898, mai 2017.

    La surface et le volume par classe de diamètre du graphique de distribution des racines sont calculés précisément avec le diamètre des racines mesurées. Pour chaque pixel du squelette, le volume et la surface de la racine sont calculés avec le diamètre ponctuel de la à la position du pixel et ajoutés à la classe de diamètre appropriée. Cette méthode est plus précise que l'estimation du volume et de l'aire de la classe à partir du diamètre moyen de la classe.

    Vous pouvez obtenir plus d'informations sur la façon dont les mesures sont effectuées dans le manuel d'instructions WinRHIZO à l'annexe C. 

  3. Analyse lente : Les paramètres/fonctions ci-dessous ont un impact important sur la vitesse d'analyse de WinRHIZO. 
    1) Filtres dans Analyse/Filtres de débris et de bords rugueux. 
    2) L'option Racine très pâle dans la détection de racine et d'arrière-plan. 
    3) Utilisation de lasso ou de régions pondérées circulaires au lieu de rectangulaires. 
    4) Analyzer une image couleur (au lieu de niveaux de gris) ou effectuer une analyse des couleurs (dans Root & Background Detection). 
    5) Utilisation des régions d'exclusion. 
    Le processeur de l'ordinateur et la vitesse de la mémoire RAM ont un fort impact sur le temps d'analyse. La version WinRHIZO a également un impact sur la vitesse. WinRHIZO 2021 est plus rapide que 2016 qui est beaucoup plus rapide que 2012. WinRHIZO 2021 utilise le multi-threading, les anciennes versions et la police pas. L'activation de "Multi-Thread" et la désactivation de "Données 100% identiques aux versions précédentes" augmentent considérablement la vitesse d'analyse.
  4. Comment vérifions-nous que les données que le logiciel recueille à partir de la racine sont exactes ? Existe-t-il un moyen de vérifier ou de calibrer le système ?  Si vous avez acheté un système complet chez nous, vous n'avez pas besoin de calibrer, seulement de l'utiliser correctement. 
    1) Vérifiez-vous que Scanner.cal est installé (Manuel WinRHIZO Chapitre 1). 
    2) Numérisez selon nos instructions (voir le manuel du scanner STD4800 ou LA2400 pour WinRHIZO et le didacticiel vidéo qui se trouve dans le dossier WinrHIZO sur votre ordinateur). 
    3) Vérifiez que les racines sont bien détectées (voir les chapitres Présentation et Introduction dans le manuel WinRHIZO) ; a) En regardant les lignes squelettes (il devrait y avoir une ligne sur toutes les racines) et b) l'image des racines détectées (les racines doivent être noires et l'arrière-plan blanc). Apprendre WinRHIZO à l'aide de nos images de démonstration et du chapitre Introduction est très important car toutes les notions fournies y sont fournies.
  5. Pouvons-nous analyseur plusieurs systèmes racine par image ?  Oui. Si vous cliquez sur l'image, tous seront analysés ensemble comme un système racine unique (une ligne de données pour chacun d'eux). Si vous souhaitez éventuellement des données séparées pour chacun, espacez-les afin qu'elles ne se touchent pas avant la numérisation et au moment de l'analyse, faites une sélection d'images autour de chacun. Vous obtenez une ligne de données par système racine.    
  6. Pouvons-nous couper et numériser un grand système racinaire en plusieurs images ? Oui pour la plupart des analyses (morphologie des racines et analyse des liens), pas pour certaines (comme la topologie et les analyses de développement qui ont abouti à un système racinaire complet). Si vous donnez à tous les sous-échantillons le même nom lors de l'analyse, leurs données peuvent ensuite être fusionnées dans XLRhizo.
  7. WinRHIZO peut-il mesurer automatiquement les racines dans le sol ?  Dans de rares cas oui. A noter que nous avons bien deux familles de produits pour la mesure des racines. 
    1) WinRHIZO Tron qui est un logiciel de traçage manuel des racines. Il est fait pour les racines en terre ou les racines qui n'ont pas un bon contraste avec leur fond. Cela fonctionnera sur n'importe quelle image dans laquelle vous pourrez voir les racines (et faire une calibration). 
    2) WinRHIZO Basic, Reg, Pro ou Arabidopsis. Ceux-ci peuvent mesurer automatiquement les racines lavées ou les racines avec un 
    bon contraste avec leur fond. La version Pro (ou Arabidopsis) est requise pour l'analyse des couleurs (lorsque la couleur est utilisée pour séparer la racine de son arrière-plan). Dans certains cas, ce dernier peut être utilisé pour mesurer les racines dans le sol, mais pour que cela fonctionne, le contraste doit être bon et/ou le sol doit être d'une couleur différente de celle des racines.
  8. WinRHIZO peut-il mesurer automatiquement les mycorhizes ? 
    Nous n'avons aucune expérience dans la manipulation et la préparation des mycorhizes. En tant que tel, nous ne pouvons pas recommander une méthode de préparation ou dire si un scanner peut être utilisé. On peut dire que les images des caméras sont adaptées si le grossissement approprié est utilisé (via des lentilles ou un microscope). Il pourrait y avoir des chances qu'un scanner fonctionne pour des ectomycorhizes plus grandes. 
    Nous avons reçu des images d'utilisateurs au fil du temps, dont certaines pourraient être analysées et d'autres non. La raison du succès/échec provenait principalement de la variation d'apparence qui résultait des différentes méthodes de préparation. Pour mesurer les mycorhizes, elles doivent contraster avec les racines et le fond. Dans certains cas, lorsque le système racinaire est trop dense, nous ne pouvons quantifier que la zone de l'image couverte par les mycorhizes, les racines et le fond environnant. Lorsque le système racinaire n'est pas trop dense et qu'un bon contraste de couleur est obtenu entre racine et mycorhizes, on peut mesurer les paramètres morphologiques racinaires (longueur racinaire, surface, volume...) pour les racines mycorhizées et non mycorhizées. Dans ce dernier cas, la version Pro ou Arabidopsis est requise car l'analyse des couleurs est utilisée. 
    Ainsi avant de recommander WinRHIZO pour une application mycorhizes, nous vous demandons un échantillon d'image pris dans les conditions réelles de votre projet (image que vous comptez utiliser pour l'analyse).
  9. Poils absorbants . Il n'y a pas de traitement spécial pour les poils absorbants par défaut (avec nos réglages automatiques). Ils peuvent être inclus dans les données racine ou d'arrière-plan. Cela dépend de la façon dont leurs niveaux de gris sont proches de la racine par rapport à l'arrière-plan et cela n'est pas uniforme entre les espèces, les utilisateurs, les paramètres d'acquisition d'images, etc. il s'agit de poils absorbants, une classification manuelle de détection de racine et d'arrière-plan peut être nécessaire pour que les données sur les poils tombent dans le groupe que vous voulez. La façon de déterminer dans quel groupe les cheveux ont été classés est de regarder l'image "Racines détectées" après une analyse. Vous pouvez également visualiser cette classification lors de la configuration des paramètres de détection de racine et d'arrière-plan (afin que vous puissiez choisir les bons). 
    Notez que si les poils ont une couleur différente de celle des racines, l'analyse des couleurs peut produire de meilleurs résultats. 
    Le microscope est très probablement nécessaire pour identifier et mesurer les poils individuellement. Avec un scanner, c'est plutôt une enveloppe qui peut être vue et mesurée (peut-être quelques cheveux individuels à très haut dpi).
  10. Nodules Nématodes . Vous pouvez compter les nodules manuellement avec toutes les versions de WinRHIZO (en cliquant sur chacun d'eux). 
    Si les nodules ne se touchent pas et s'ils présentent des contrastes de couleur avec les racines (naturellement de via coloration), alors certains de nos logiciels peuvent les compter (dont la version WinRHIZO Arabidopsis). Notez que nous avons rarement vu des situations où cela fonctionnait bien automatiquement. Il y a un exemple des deux méthodes de comptage des nodules dans le manuel d'instructions de WinRHIZO dans le chapitre "Exemples d'application".
  11. Charger la configuration ne fonctionne pas (WinRHIZO 2021a et b) . Ce bug a été corrigé. Contactez-nous pour obtenir la version corrigée 2021c.
  12. La lumière TPU n'est pas utilisée . Assurez-vous que le TPU est connecté au scanner à l'arrière de celui-ci et que vous avez sélectionné "Niveaux de gris" à droite de "Type d'image" (ne choisissez pas "Couleur"). Important : Au démarrage, ne sélectionnez PAS une source TWAIN dont le nom commence par "WIA...").
  13. Conseils pour une meilleure détection des racines fines très pâles . Dans Paramètres d'image/d'acquisition, désactivez "Priorité à la vitesse". Augmentez le dpi (à 800 ou plus). Si possible, placez les racines directement sur la vitre du scanner, évitez d'utiliser l'eau. Essayez l'option "Racine très pâle" dans Paramètres d'image/d'acquisition. Voir les autres conseils dans le manuel d'instructions WinRHIZO, il y a une section dédiée à cela.
  14. Le logiciel WinRHIZO peut-il analyser n'importe quelle image de n'importe quel scanner ou appareil photo ? La réponse courte est non. WinRHIZO est un système composé de logiciels et de matériel qui ont été conçus pour s'adapter les uns aux autres. Comme nos scanners produisent des images très contrastées, sans ombres, l'analyse est très simple et rapide (en utilisant les paramètres par défaut de WinRHIZO). Si vos images ne répondent pas à ces critères, les paramètres par défaut ne peuvent pas être utilisés et l'opérateur doit tester différents paramètres. L'analyse est donc plus complexe, difficile, prend plus de temps et généralement moins précise que celles faites sur les images de nos scanners. Le problème le plus fréquent que nous constatons est que toutes les racines ne sont pas détectées ou que des artefacts (ombres, débris...) sont analysés comme des racines. Bien qu'il existe des filtres pour supprimer certains de ces artefacts, il n'est pas garanti qu'ils fonctionnent. Au fil des ans, nous avons ajouté des fonctionnalités permettant d'analyser les racines de différents supports ou appareils d'imagerie. Ceux-ci doivent être testés avant achat pour déterminer si WinRHIZO peut les analyser ou non. Veuillez également noter que si aucun matériel n'est acheté chez nous, notre personnel du soutien technique ne pourra pas vous aider en cas de problème (en d'autres termes, nous ne prendrons en charge que le matériel que nous vendons).

 

14. WinRHIZO TRON

Cette section contient des rubriques d'aide relatives à WinRHIZO Tron.

  1. Analyse manuelle ou automatique des racines :  "WinRHIZO Tron" est un logiciel de traçage des racines entièrement manuel. Cela signifie que pour mesurer les racines, vous devez les tracer de manière interactive (manuellement). Nous avons un autre produit appelé « WinRHIZO Basic, Reg, Pro ou Arabidopsis » qui peut faire une mesure automatique des racines, mais c'est pour les racines lavées (racines extraites du sol). Parfois, il peut être utilisé pour mesurer automatiquement les racines dans le sol (lorsque les contrastes entre les racines et le sol sont bons). Nous pouvons dire si la version automatique peut être utilisée pour vos échantillons si vous nous envoyez une image.
  2. Le logiciel WinRHIZO Tron plante lors de l'ouverture d'une image :  (versions antérieures à 2022) cela était dû à l'utilisation d'un nom d'image non conforme ICAP alors que cette dernière était active. Pour résoudre ce problème, il existe deux options : 1) fourni-vous que le nom de votre image est conforme au schéma de désignation ICAP ou, si ce n'est pas le cas, 2) désactivez "Utiliser le schéma de désignation ICAP" dans Analyse/Paramètres.
  3. Impossible d'activer la commande New Calibration : ce bogue est maintenant corrigé, mais si votre version l'a, il existe une solution de contournement : choisissez la méthode de calibration "Intrinsic". Chargez votre image avec une échelle. Changez la méthode de calibration en "Echelle dans l'image". "Nouvelle calibration" est maintenant actif.
  4. Impossible de modifier l'identification de l'échantillon, le nom de la racine ou les propriétés dans le fichier de données :  WinRHIZO Tron ne peut modifier que le contenu du fichier de données pour l'image en cours d'analyse (région verte où les racines sont actuellement tracées), pas celles analysées précédemment (régions rouges). Vous pouvez cependant modifier les données précédemment enregistrées dans un logiciel comme Excel. Faites une sauvegarde de votre fichier avant de le faire, au cas où les choses tourneraient mal. 1) Importez le fichier de données .txt dans Excel (voir l'annexe A du manuel d'instructions de WinRHIZO Tron), 2) Modifiez les cellules de données que vous souhaitez modifier et 3) Enregistrez le fichier de données en tant que .txt.

 

15. WinSEEDLE

Cette section contient des rubriques d'aide relatives à WinSEEDLE.

  1. Quelle est la qualité de WinSEEDLE pour les très grosses graines (chêne) ? Lorsque les graines sont grosses (plus de 1 cm), vous devez prévoir des mesures plus précises avec des images acquises à partir d'un appareil photo. Le logiciel WinSEEDLE (comme tous nos autres logiciels) peut analyser des images provenant d'un appareil photo ou d'un scanner. Vous pouvez utiliser presque n'importe quel appareil photo numérique à condition d'avoir une bonne configuration pour l'acquisition d'images (qui offre de bons contrastes entre les graines et l'arrière-plan, sans ombres). Vous aurez également besoin d'un appareil pour maintenir l'appareil photo au-dessus des graines et d'une cible de calibration (échelle, règle...).
  2. La lumière TPU n'est pas utilisée . Assurez-vous que le TPU est connecté au scanner à l'arrière de celui-ci et que vous avez sélectionné "Niveaux de gris" à droite de "Type d'image" (ne choisissez pas "Couleur"). Important : Au démarrage, ne sélectionnez PAS une source TWAIN dont le nom commence par "WIA...").

 

16. WinFOLIA

Cette section contient des rubriques d'aide relatives à WinFOLIA.

  1. Quelle est la portabilité de WinFOLIA ? Notre scanner LC1200P tire actuellement sa puissance de travail (énergie) d'un ordinateur via une connexion USB (qui est également utilisée pour transférer les images). Il est compatible TWAIN, ce qui signifie que WinFOLIA peut acquérir et analyser des images directement à partir de celui-ci (sans l'utilisation d'un autre logiciel). Pour faire fonctionner ce scanner, un ordinateur est nécessaire sur le terrain. Numériser des images sur le terrain n'est pas aussi facile qu'en laboratoire, mais c'est faisable. Certains écrans d'ordinateur ne sont pas faciles à lire sous le soleil (prévoir un parapluie) et il faut veiller à éviter l'eau ou l'humidité excessive pour l'ordinateur et le scanner. L'analyse des images sur le terrain peut être effectuée, mais le risque d'une mauvaise analyse est plus grand que lorsqu'elle est effectuée en laboratoire, où l'utilisateur peut prendre le temps de la vérification. Le risque est moindre si des analyses simples sont réalisées (surface foliaire). Une autre option consiste à numériser sur le terrain, à stocker les images sur le disque de l'ordinateur et à analyser les images de manière interactive ou par lots en laboratoire. 
    Les feuilles peuvent être retirées de la plante pour un balayage plus faciles ou peuvent rester sur la plante pour un balayage non destructif. Dans ce dernier cas, l'utilisateur doit pouvoir approcher le scanner et l'ordinateur de la plante et le pétiole doit être suffisamment long pour placer la feuille sur le scanner (sans zone foliaire manquante). 
    Notez qu'un scanner de bureau avec ou lumière SLS comme nos modèles STD4800 ou LA2400 offre une option de plus pour l'analyse des feuilles. Les images réalisées avec cette lumière sont généralement plus contrastées.
17. WinSCANOPY

Cette section contient des rubriques d'aide relatives à WinSCANOPY.

  1. Utilisation de WinSCANOPY avec un appareil photo et un objectif autres que ceux vendus par Regent. Vous devez indiquer dans votre image le centre de l'hémisphère et le rayon correspondant au champ de vision (FOV) de 180 degrés qui correspondent à l'horizon. Notez que les lentilles fish-eye ont un champ de vision différent. Parfois c'est 180 (le rayon correspond au contenu de la canopée/du ciel ou à la zone non noire) mais souvent nous voyons 185 et parfois plus. Dans de tels cas, vous devez déterminer expérimentalement le 180 FOV. Vous devez le faire à la résolution la plus élevée de la caméra. Si vous acquérez des images à des résolutions inférieures par la suite, WinSCANOPY se mettra automatiquement à l'échelle le rayon pour s'adapter à l'image. Il est cependant important de toujours utiliser le même format d'image. Les appareils photo reflex numériques ont généralement un rapport 3 : 2, mais certains appareils photo offrent également des rapports 3 : 4 ou 1 : 1. Ce dernier est meilleur car il produit des images plus petites avec moins de zone noire. 
    Ensuite, vous devez déterminer, expérimentalement ou à partir des spécifications du fabricant d'objectifs, les paramètres de calibration de l'objectif (non linéarités d'élévation en fonction de la distance au centre de l'hémisphère) et les saisir dans Hémisphère /Caméra et objectif/Calibration de l'objectif. 
    Une fois que vous avez saisi les spécifications de votre appareil photo et de votre objectif dans Hemisphere/Camera & Lens, celles-ci seront utilisées pour toutes les images que vous analyserez jusqu'à ce que vous les modifiez. Il est préférable d'enregistrer vos paramètres WinSCANOPY (qui inclut votre appareil photo et votre objectif) dans un fichier de configuration (à l'aide de Misc/Save Configuration). De cette façon, vous aurez une copie de sauvegarde et cela vous permettra également de changer rapidement de caméra et d'objectif (à l'aide de Misc/Load Configuration). 
    Si vous possédez un de nos appareils photo et objectif, tout ce travail est fait par nous et tout ce que vous avez à faire pour analyser une image est de cliquer dessus. La position et la taille de l'hémisphère seront connues de WinSCANOPY et les bons paramètres de calibration de l'objectif seront utilisés. Toutes ces informations sont fournies dans le fichier "Lens.cal" fourni avec nos systèmes, il est donc important de sélectionner "Depuis le fichier Lens.cal" dans Hemisphere/Camera & Lens (il est actif par défaut).

 

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Dernière révision: 28 octobre 2024