Après l'acquisition de l'image, vous indiquez à WinDENDROoù mesurer les cernes dans l'image. Cela se fait en traçant les chemins de manière interactive. Des chemins en ligne droite (tels que ceux qui s'étendent du centre d'un disque à l'écorce) peuvent être créés automatiquement par un simple clic de souris (jusqu'à quelques centaines en un seul clic). Des chemins de forme plus complexes (voir ci-dessous) sont créés manuellement en cliquant à différents endroits.

Une fois les chemins créés, les cernes sont automatiquement détectés par WinDENDROet leur présence est indiquée sur l'image par des lignes et du texte. Les lignes indiquent la position et l'orientation du début des cernes et le texte indiquent l'année et le numéro du cerne. La largeur du bois initial peut également être affichée avec d'autres caractéristiques du cerne (expliquées ci-après). Près de l'image, un profil des variations de lumière à l'intérieur du chemin est également affiché avec les largeurs des cernes et du bois initial. Cette région est également utilisée pour régler la sensibilité de la détection automatique du cerne. La sensibilité de cette détection initiale peut être ajustée en fonction de l'apparition des cernes. Les cernes étroits et à faible contraste demandent plus d'attention.

Une ou quatre méthodes de détection de cernes sont fournies en fonction du modèle du logiciel WinDENDROLa première méthode est basée sur les différences d'intensité lumineuse. C'est simple, efficace et fonctionne très bien pour les cernes contrastés, comme ceux des conifères. Une autre méthode de détection des cernes s'appelle Teach & Show et est une méthode où vous montrez à WinDENDROce qu'est un cerne d'arbre dans l'image afin qu'il puisse les détecter automatiquement après. Cette méthode et deux autres sont bien adaptées aux cernes peu contrastés, comme ceux des feuillus. Il y a cependant des limites et un contraste minimal est nécessaire pour obtenir un bon niveau de détection automatique. Lorsque le contraste est trop faible, vous pouvez travailler en mode manuel où vous indiquez la position des cernes dans l'image en cliquant dessus.

Les cernes peuvent être tagués avec des observations que vous sélectionnez (vous choisissez leur nom, leur signification et le symbole utilisé pour indiquer leur présence à proximité d'un cerne). Par exemple, vous pouvez définir deux caractéristiques appelées "étroit" et "gel" et sélectionner les cernes qui ont ces caractéristiques. Ces caractéristiques des cernes sont ensuite affichées sur le graphique et dans l'image à proximité des cernes qui ont ces caractéristiques.

Aucune modification n'est apportée à l'image originale qui est toujours disponible pour de futures références ou analyses. Les images peuvent également être exportées vers d'autres logiciels (pour créer un rapport par exemple). Elles peuvent également être enregistrées avec leurs analyses et être ensuite récupérées et éditées ou validées par WinDENDRO.

Après la détection automatique initiale des cernes, une validation doit être effectuée pour considérer la possibilité de la présence de faux cernes, cernes de gel, cernes localement absents ou simplement d'une mauvaise classification effectuée par WinDENDRO. Dans ce contexte, nous disons que WinDENDROest un système semi-automatique plutôt qu'automatique. Cela se fait en parcourant l'image et en recherchant les cernes manquants ou faux. Contrairement aux systèmes basés sur des tables de positionnement, vous pouvez effectuer des allers-retours le long des trajectoires des cernes sans perte de précision (due au jeu des engrenages). Les cernes identifiés précédemment peuvent être revus à tout moment, même des années plus tard. L'ajout ou la suppression de cernes se fait facilement de manière interactive. Lorsque la souris est maintenue au-dessus d'un cerne, ce dernier est mis en surbrillance (en jaune, comme illustré). Cliquer dessus supprime le cerne, cliquer à un endroit où il n'y a pas de cerne en ajoute un. Les cernes peuvent être supprimés par groupes, déplacés ou réorientés. La position des limites entre le bois initial et le bois final peut également être annulée. Au fur et à mesure des modifications, le numéro et l'année des cernes sont automatiquement mis à jour dans l'image et le graphique de largeurs des cernes.

Un graphique des largeurs de cernes en fonction de l'année est affiché lors de l'analyse et est automatiquement mis à jour au fur et à mesure de l'édition des cernes lors de la phase de validation (versions Reg et Density). Ce graphique est également utilisé pour la datation croisée visuelle et numérique. Il peut afficher simultanément les chronologies principales et les largeurs de cernes de l'échantillon analysé et corréler certaines d'entre elles pour aider à trouver des erreurs dans l'analyse. Les séries de largeur de cernes peuvent être redressées (converties en indices) à l'aide de la méthode des splines de lissage.

La spline de lissage peut être affichée pour aider à déterminer sa force de filtrage.

Des squelettes tracés peuvent être affichés pendant les mesures d'une ou plusieurs séries simultanément avec des chronologies maîtresses. Ceux-ci sont utilisés par les dendrochronologues pour identifier les cernes plus petits ou plus grands que leurs voisins pour une datation croisée visuelle.

Les largeurs de cernes peuvent être affichées telles quelles (mesurées en millimètres) ou sous forme de valeurs d'indice (largeurs des cernes pour lesquelles les variations non climatiques à long terme, telles que celles dues au vieillissement des arbres ont été supprimées) et peuvent également être convertis en échelle logarithmique pour augmenter les effets des variations des cernes étroits.

De nombreuses commandes interactives sont associées au graphique. Par exemple, lorsque vous cliquez sur une année dessus, l'image défile pour afficher la partie de l'image où se trouve ce cerne. La série de largeurs de cernes peut être divisée et décalée à différents endroits (et la corrélation mise à jour) pour aider à trouver les cernes manquants ou faux. Les modifications effectuées en ajoutant des cernes aux points de fractionnement peuvent être portées sur l'échantillon analysé en activant une commande. Trois points de séparation où les séries de données peuvent être décalées indépendamment. Plus de points peuvent être ajoutés ou supprimés.

WinDENDROest disponible avec ou sans fonction d'analyse de densité. Les principes qui derrière l’analyse de densité deWinDENDROsont bien connus et sont appliqués depuis plusieurs années dans l'analyse des cernes de croissance. Différentes méthodes peuvent être appliquées pour effectuer une analyse de densité dans WinDENDRO:

• La méthode conventionnelle sur film
  Cette méthode est la plus ancienne et la plus largement utilisée pour l'analyse de densité des cernes par les dendrochronologues. Il est bien documenté dans le livre du Dr. Schweingruber "Basic and Applications of Dendrochronology". Des échantillons de bois sont découpés en tranches fines (1 à 2 mm d'épaisseur), amenés à un taux d'humidité prédéterminé et exposés aux rayons-x sur un film. Le film est alors développé. Dans WinDENDRO, le densitomètre analogique conventionnel est remplacé par une méthode numérique qui consiste à balayer le film rayons-x puis à mesurer la lumière qui passe à travers une fente virtuelle balayée au-dessus des cernes. Contrairement au densitomètre analogique, des paramètres tels que la taille de la fente peuvent être facilement modifiés. Lors du calcul de la densité, WinDENDRO définit automatiquement l'angle de fente tangente à la limite du cerne afin de produire des mesures précises. L'angle de fente change linéairement son orientation progressivement entre les cernes de sorte qu'il soit tangent à toutes les limites des cernes. L'opérateur peut remplacer de manière interactive l'angle de fente estimé par WinDENDRO.

• La méthode Blue Reflectance
  Cette méthode ne produit pas de mesures de densité mais un substitut de celle-ci. Elle estime les données de densité en se basant sur l'hypothèse que la couleur du bois (ou la réflectance dans la bande bleue) est liée à la densité. Ces dernières années, certains chercheurs ont obtenu des résultats intéressants en utilisant le canal bleu des images en couleur. Un avantage majeur de la méthode de la lumière réfléchie est qu'elle ne nécessite pas d'équipement de rayonnement coûteux. Cela nécessite cependant une bonne compréhension de ses limites.

• La méthode d'imagerie par rayons-x numérique sans film
  Il est possible d'utiliser les caméras ou scanners à rayons-x numériques sans film les plus récents (non vendus par Regent) pour acquérir des images rayons-x de morceaux de bois et ensuite mesurer leur densité. Certains systèmes exigent que les pièces de bois soient encore préparées, comme décrit ci-dessus. La densité est mesurée dansWinDENDRO à partir de ces images exactement comme elle l'est à partir de films numérisés (sauf pour la calibration).

Plusieurs mesures de densité peuvent être enregistrées par cernes ou par pixel. Disponible par cerne: largeur des cernes, largeur du bois initial et du bois final (en mm ou en pourcentage de la largeur des cernes), densité maximale des cernes, densité minimale des cernes, densité moyenne des cernes, densité moyenne du bois initial, densité moyenne du bois final et orientation des limites des cernes. Disponible par pixel le long d'un chemin de cerne: densité de pixels ou intensité lumineuse (calibrée ou non) et orientation de la fente.

Lorsqu'une image analysée est enregistrée dans un fichier, l'analyse est automatiquement enregistrée avec celle-ci. Cette analyse peut ensuite être récupérée, validée ou modifiée simplement en chargeant l'image dans WinDENDRO. Les données d'analyse telles que la largeur du cerne, la densité minimale, etc. sont également enregistrées dans des fichiers texte standard qui peuvent être lus par de nombreux programmes, y compris des logiciels de style tableur comme Microsoft Excel. WinDENDROpossède son propre format (documenté dans son guide d'utilisation) pour inscrire ces données mais peut aussi convertir des fichiers au format Decadal (Tucson) utilisé par les dendrochronologues (au 1/100 ou 1/1000 de mm de précision). Contrairement au format Decadal, le format WinDENDRO permet d’inscrire les paramètres d'analyse, la date et l'heure, les informations d'image ainsi que les mesures des cernes.

XLStem est un programme d'analyse de tiges (ensemble de macros) qui s'exécute dans Microsoft Excel. Il permet de visualiser les données produites par WinDENDRO et de faire des analyses de tiges standards (comme reconstituer la croissance des arbres en fonction de leur âge, mesurer le volume des arbres...). Les calculs peuvent être effectués de manière interactive sur des arbres sélectionnés ou par lots.

XLStem calcule les informations suivantes à partir des données de largeur de cernes produites par WinDENDRO:

• Rayon moyen (méthode quadratique), diamètre et surface par disque (cumulatif ou incrémental)
• Hauteur et volume des arbres en fonction de l'âge ou de l'année (cumulatif ou incrémental)
• Informations de base et résumé sur l'arbre

Il dispose de trois méthodes d'interpolation de hauteur: Linear, Carmean and Newberry.

WinDENDROest livré avec un manuel illustré en couleur (imprimé et en fichier pdf), en plus d’un support technique rapide et compétent (par e-mail). Le temps de réponse typique est d'une heure. Il est réalisé par des personnes compétentes qui peuvent s'appuyer sur les programmeurs de WinDENDROpour des conseils techniques.

WinDENDROfait partie d'une famille de produits connexes pour la recherche en sciences végétales et la production. Parmi eux, vous trouverez: WinCELLpour l'analyse des cellules anatomiques du bois, WinRHIZO & WinRHIZO Tronpour l'analyse des racines (extraites et dans le sol) WinSCANOPY pour l’analyse de la canopée et du rayonnement à partir d'images hémisphériques fisheye WinCAM pour l'analyse de couleurs WinFOLIA pour l'analyse des feuilles WinSEEDLE pour les semences et analyse d'aiguilles

La forte augmentation des performances des scanners et des ordinateurs et la baisse des prix au fil des ans ont fait des systèmes WinDENDRO plus qu'une solution abordable pour mettre en place une installation d’analyse de cernes d'arbres. Son coût se compare favorablement aux systèmes manuels basés sur des binoculaires et des tables de positionnement.