WinFOLIA is for Leaf Analysis

Le Logiciel WinFOLIA est disponible en trois versions: Basic, Reg & Pro

WinFOLIA Basic est notre solution d'entrée de gamme à faible coût pour l'analyse des feuilles. Cette version imite la fonctionnalité des appareils de mesure de surface foliaire portables. Il mesure la surface des feuilles, la longueur et la largeur de manière simple comme avec ces appareils (dans les directions horizontales et verticales), le périmètre, la surface des trous et quelques autres mesures (voir tableau ci-dessous).

WinFOLIA Reg reprend toutes les mesures de la version Basic plus quelques mesures morphologiques spécifiques aux feuilles. Par exemple, il peut différencier le limbe du pétiole afin que vous puissiez choisir d'inclure ou non le pétiole dans les mesures de surface, de longueur et de périmètre. Il peut mesurer la largeur de différentes manières et les angles de lobe et d'apex. Cette version a également plus de fonctionnalités, comme la possibilité d'ajouter des observations, de faire des mesures interactives définies par l'utilisateur et quelques autres.

WinFOLIA Pro a toutes les mesures de la version Reg plus quelques mesures morphologiques étendues (telles que Fractales, enveloppe - coque convexe, dents...). Cette version offre également l’analyse couleurs qui peut être utilisée pour quantifier les maladies, la nécrose et les dommages causés par les insectes.

Mesures par version du logiciel WinFOLIA

MESURES	Basic	Reg	Pro	Description
Comptage automatique des feuilles	√	√	√	Le nombre de feuilles valides dans la région analysée. Elles ne doivent pas se toucher.
Surface projetée des feuilles (totale, moyenne et individuelle)	√	√	√	Zone de feuilles (limbe+pétiole) projetée sur un plan 2D (la vitre du scanner).
Longueur de la feuille	√	√	√	Dans le sens Vertical, par 2 méthodes. (Longueur de la feuille = Longueur du limbe + Longueur du pétiole).
Largeur maximale et moyenne des feuilles	√	√	√	Dans le sens horizontal, par 2 méthodes.
Rapport d'aspect des feuilles	√	√	√	Rapport entre la largeur horizontale et la longueur verticale.
Périmètre de la feuille	√	√	√	Périmètre (limbe+pétiole) mesuré sur la zone projetée en 2D sur la vitre du scanner
Coefficient de forme des feuilles	√	√	√	Une valeur numérique qui classe la forme de la feuille entre circulaire (périmètre le plus court pour une zone donnée) et filiforme (périmètre le plus long pour une zone donnée).
Superficie des trous (totale et individuelle)	√	√	√	Superficie totale des trous dans la lame et éventuellement leurs zones individuelles.
Zone de limbe (individuelle)		√	√	Sans pétiole.
Longueur du limbe et du pétiole		√	√	Longueur des feuilles = Longueur du limbe + Longueur du pétiole.
Largeur maximale et moyenne de la limbe		√	√	Perpendiculaire à la longueur du limbe.
Périmètre du limbe		√	√	Sans pétiole.
Largeur du limbe à 2 positions définissables par l'utilisateur		√	√	L'utilisateur choisit deux % de la longueur du limbe où les largeurs de limbes sont mesurées.
Angle du lobe à 2 positions définissables par l'utilisateur		√	√	L'utilisateur choisit deux % de la longueur du limbe où les angles de lobes du limbe sont mesurés.
Angle de l'apex à 2 positions définissables par l'utilisateur		√	√	L'utilisateur choisit deux % de la longueur du limbe où les angles à l'apex des limbes sont mesurés.
Longueurs et angles interactifs définissables par l'utilisateur		√	√	Pour mesurer manuellement n'importe quel objet (de manière interactive).
Observations des opérateurs		√	√	N'affecte pas les mesures, sont là à des fins de notation.
Analyse des couleurs (quantification de la surface par couleur)			√	Pour la quantification des maladies, le filtrage des débris et une méthode alternative de distinction des feuilles par rapport à l'arrière-plan.
Classification des couleurs des feuilles			√	Classer les feuilles en groupes en fonction des zones de couleurs présentes sur elles (en utilisant di"érents critères ajustables).
Zone d'enveloppe			√	Longueur d'une ligne qui va de dent en dent du limbe au sommet.
Hauteur, largeur et nombre de dents			√	Compte et mesure la hauteur et la largeur des dents du limbe.
Fractales			√	Pour l'analyse de la forme des feuilles. Peut être fait sur toutes les feuilles en pixels (surface) ou sur leur périmètre.

Les versions Reg et Pro peuvent mesurer la surface et lalongueur du limbe et du pétiole séparément ou ensemble (dans son ensemble).

Toutes les versions peuvent produire une surface foliairetotale et moyenne (pour toutes les feuilles de l'image) ainsi que des surfaces individuelles (par feuille).

Toutes les versions peuvent mesurer le périmètre (limbe+pétiole) mais seules les versions Reg et Pro peuvent mesurer le périmètre du limbe sans le pétiole.

La Longueur et Largeur Maximale de la feuille ou du limbe peuvent être mesurés de différentes manières. La méthode la plus simple est disponible dans toutes les versions. La longueur de la feuille est mesurée en fonction de la plus grande distance entre les points les plus hauts et les plus bas appartenant à la feuille dans la direction verticale (sur la même ligne verticale) et la largeur est la distance entre les points les plus à gauche et à droite dans la direction horizontale (sur la même ligne horizontale).

La Longueur et Largeurpeuvent également être mesurées par la taille verticale et horizontale de la boîte englobant la feuille (distance entre les points de délimitation les plus à gauche et les plus à droite de la feuille), mais contrairement à la méthode ci-dessus, ceux-ci ne doivent pas nécessairement être sur la même ligne. La Largeur moyenne est la moyenne de toutes les largeurs mesurées le long de la feuille.

Avec les versions Reg et Pro, la Longueur peut être mesurée par la distance entre l'apex et la jonction pétiole-limbe (toute orientation) et la Largeurcomme la plus grande largeur perpendiculaire à la longueur du limbe. Ces versions peuvent également mesurer la largeur à deux positions différentes que vous spécifiez le long de la longueur du limbe.

	L'envelope est la longueur d'une ligne qui va de dent en dent sur leur sommet. La surface couverte par l'enveloppe peut être mesurée par WinFOLIA Pro. Hauteur, largeur et nombre de dents. Les fractales sont un moyen de quantifier la complexité de la forme d'une feuille.	Dent (jaune) Enveloppe (magenta)

WinFOLIA Pro peut quantifier la surface par couleur, mesurer sa dominante et classer les feuilles en fonction de celle-ci ou d'autres critères (il peut classer une feuille comme malade si le groupe de couleur malade a la plus grande surface ou est supérieur à un pourcentage donné). La classification de la couleur des feuilles peut être vue à l'écran. Les couleurs d'intérêt sont spécifiées à WinFOLIAsimplement en cliquant sur l'image. Les classes peuvent être regroupées afin de mesurer les zones avec plus d'une couleur (par exemple, la zone malade peut contenir du marron et du jaune). La classification est effectuée par analyse des couleurs réelles dans un espace couleur 24 ou 48 bits, sans utiliser un simple seuil de couleur comme dans certains autres programmes d'analyse de feuilles.

Caractéristiques par version du logiciel WinFOLIA

CARACTÉRISTIQUES	Basic	Reg	Pro	Description
Logiciel XLFolia	√	√	√	Pour les données produites par WinFOLIA, visualisation et analyse dans Excel.
Filtrage automatique des défauts et des débris basé sur le lissage de la zone et de l'image	√	√	√	Pour enlever les débris et lisser les bords des feuilles lorsqu'elles sont rugueuses.
Mesures visibles sur les images	√	√	√	Les lignes indiquent où et comment la longueur, la largeur, le périmètre… ont été mesurés.
Des corrections peuvent être effectuées par l'opérateur	√	√	√	En ajustant les paramètres d'analyse ou en rejetant manuellement les feuilles.
Régions rectangulaires analysées et d'exclusion	√	√	√	Choisissez la région de l'image pour l'analyser ou l'exclure (forme rectangulaire).
Régions analysées et d'exclusion de style circulaire et libre		√	√	Choisissez la région de l'image pour l'analyser ou l'exclure (forme circulaire ou irrégulière).
Filtrage automatique des défauts et débris selon plusieurs critères		√	√	Basé sur di"érents critères (longueur, largeur, périmètre, coe#cient de forme, rapport hauteur/largeur et pour la version Pro couleur).
Analyse par lots		√	√	Analysez les images par lots sans supervision d'un opérateur.
Édition d'images		√	√	Supprime les artefacts, les débris ou les défauts.
Plusieurs documents		√	√	Analysez jusqu'à 16 échantillons simultanément dans différentes fenêtres principales de WinFOLIA.
Histogramme de répartition des feuilles		√	√	Affiche la répartition des feuilles en fonction de différentes données morphologiques (surface, longueur, largeur…).
Histogramme de répartition des zones de couleur			√	Affiche la répartition des zones en fonction de la couleur.
Détection automatique de l'arrière-plan basé sur la couleur			√	Pour les images acquises avec une caméra lorsque l'arrière-plan ne couvre pas la totalité de l'image.
Compensation des inégalités de fond			√	Supprime la non-uniformité de l'éclairage (attention: il est préférable de le faire avant l'acquisition de l'image).

Edition d'images permet de modifier le contenu de l'image pour supprimer les artefacts, les débris ou, comme illustré ci-dessous, pour combler les trous. Vous pouvez choisir la couleur à éditer en sélectionnant une présente dans l'image ou définir la vôtre.

Dans cet exemple, un rebord de feuille endommagée est fermé avec l'édition d'image à l'aide de l'outil stylo afin que les trous sur son bord puissent être mesurés automatiquement par WinFOLIA.		Dans cet exemple, une zone de feuille endommagée est remplie en brun à l'aide de l'édition d'image avec l'outil pinceau (un lasso est également disponible). Dessiner une région de la même couleur que la feuille permet de l'inclure dans la zone de la feuille tandis que la dessiner d'une couleur différente permet de la mesurer dans les trous ou la zone d’arrière-plan.

• Pendans l'analyse, vous pouvez visualiser la répartition de la surface foliaire (couleur ou autres paramètres morphologiques) en classes que vous choisissez dans un graphique au-dessus de l'image.

• La Classification des pixels est la séparation des pixels de l'image (éléments d'image) dans les groupes de feuilles et d'arrière-plan (une condition préalable pour des mesures précises). Ce processus peut se faire automatiquement (avec validation de l'utilisateur selon différentes méthodes en fonction de la version de WinFOLIA) ou manuellement. S'il y a des classifications erronées dans certaines zones de l'image, l'opérateur peut les remplacer de manière interactive en empêchant d'analyser cette zone (en la décrivant) et en modifiant les paramètres de classification.

Divers

Les données produites par WinFOLIA sont enregistrées dans des fichiers texte ASCII. Ils peuvent être facilement ouverts par des programmes statistiques ou des tableaux tels que Microsoft Excel. Les paramètres d'analyse sont enregistrés avec les données de mesure, ce qui est utile pour effectuer des vérifications ou un contrôle qualité sur les mesures. De plus, lorsqu'une image est enregistrée dans un fichier après avoir été analysée, l'analyse est également enregistrée et lorsque ce fichier est ouvert dans WinFOLIA, l'analyse est recréée.

WinFOLIA est livré avec des manuels imprimés (et pdf) en couleur et abondamment illustrés. Comme tous les produits de Regent Instruments, vous obtenez un support technique rapide et compétent par e-mail (les messages reçus généralement une réponse dans l'heure lorsqu'ils sont reçus pendant les heures de travail, heure de l'Est de l'Amérique). WinFOLIA est mis à jour régulièrement pour ajouter de nouvelles fonctionnalités ou pour le maintenir au même niveau que les nouveaux systèmes d'exploitation.

WinFOLIA a un programme compagnon appelé WinSEEDLE pour l'analyse des aiguilles et des graines de conifères. Les deux programmes peuvent partager le même matériel d'acquisition d'images (vous devez le spécifier au moment de l'achat). Un rabais est offert lorsque les deux produits sont achetés ensemble. WinFOLIA et WinSEEDLE font partie d'une famille de produits vendus par Regent Instruments pour la recherche et l'analyse en sciences végétales. Parmi les autres produits, vous trouverez WinRHIZO pour l'analyse des racines et WinDENDRO pour l'analyse des cernes de croissance. Consultez la section Produit de notre site Web pour plus d'informations.

XLFolia est un logiciel de classement et de visualisation des données produit par WinFOLIA. Il est constitué d'un ensemble de macros qui s'exécutent dans Excel (non inclus). Ceux-ci ajoutent un menu (nommé XLFolia) aux menus standard d'Excel. Ce dernier contient des commandes pour traiter les données de WinFOLIA et créer des graphiques très facilement. Les commandes standard d'Excel restent disponibles, vous permettant d'ajouter vos propres traitements et graphiques.

	Analyse d'Images pour la Science des Plantes

Regent Instruments Inc.	depuis 1991