WinRHIZO is a complete plant root measurement and analysis systems for agricultural and forestry research.

Logiciel

Le logiciel WinRHIZO est offert en 4 versions (Basic, Reg, Pro & Arabidopsis). Le tableau ci-dessous répertorie et explique les mesures et les fonctionnalités offertes par chacun.

	WinRHIZO Basic		WinRHIZO Reg		WinRHIZO Pro		WinRHIZO Arabidopsis
	WinRHIZO Basic est une version d'entrée de gamme à faible coût. Il ne produit que des mesures globales (diamètre moyen des racines, longueur totale des racines, surface, volume et nombre de bouts).		WinRHIZO Reg possède toutes les caractéristiques du modèle de base plus la mesure de la morphologie des racines en fonction des classes de diamètre définissables par l'utilisateur. Un graphique de distribution de racine (longueur, surface, volume) est généré automatiquement et est visible au-dessus de l'image.		WinRHIZO Pro possède toutes les fonctionnalités de la version Reg plus les analyses de liens, de topologie, d'architecture et de couleur. L'analyse de la couleur peut produire la morphologie des racines en fonction de la couleur. Il peut également être utilisé comme compteur de zone de couleur.		WinRHIZO Arabidopsis possède toutes les fonctionnalités de la version Pro ainsi que la possibilité de séparer et analyser séparément des objets individuels tels que les semis et les feuilles. Il peut effectuer plusieurs analyses de racines par image analysée ou par régions de celle-ci.

Note : Il est possible de passer d'une version de base à une version plus évoluée à tout moment en payant la différence de coût entre elles.

Mesures Morphologiques des racines
	Basic	Reg	Pro	Arabid
Global (pour toute l'image)
Longueur totale
Diamètre moyen
Superficie totale
Nombre de bouts, embranchements et croisements
Comptage manuel des nodules (non automatique)
En fonction du diamètre des racines (par classe de diamètre)
Longueur
Superficie, volume
Nombre de bouts
En fonction de la couleur de la racine (voir analyse des couleurs ci-dessous)
Longueur
Superficie, volume
Nombre de bouts
Architecture de la racine avec mesures fractales
Architecture de la racine avec fractales
Analyse couleur
Analyse couleur

Mesures d’Analyse des Liens
	Basic	Reg	Pro	Arabid
Globalement (pour toute l'image)
Nombre total de liens
Longueur moyenne des liens, diamètre, surface, volume, angle de branchement
Par lien (individuellement)
Longueur, diamètre moyen, surface, angle de branchement
Connectivité de base

Measures de Topologie
	Basic	Reg	Pro	Arabid
Globalement (pour toute l'image)
Longueur du chemin externe
Altitude
Par lien (individuellement)
Ordre de grandeur
Longueur du chemin
Altitude
Connectivité structurée

Mesures de Classification Développementale
	Basic	Reg	Pro	Arabid
Nombre de liens (par ordre)
Longueur totale (par ordre)
Superficie totale (par ordre)
Longueur moyenne des liens (par ordre)
Aire moyenne des liens (par ordre)
Diamètre moyen (par lien)
Ordre des liens (par lien)

Mesures de WinRHIZO Arabidopsis
	Basic	Reg	Pro	Arabid
Différencie, compte et analyse séparément les semis, les systèmes racinaires ou les objets qui ne se touchent pas. Chaque objet a ses propres mesures en plus des mesures globales qui englobent tous les objets analysés dans l'image (ou la région de l'image).
Il peut mesurer la largeur et la longueur de la zone sélectionnée de l'objet, ce qui peut se traduire par: 1) la hauteur et la largeur de la plante lorsque l'image est une vue du côté du semis ou 2) la longueur et la largeur de la feuille (ou d'un autre objet) lorsqu'elle est vue d'en haut.
Il peut mesurer l’aire individuelle de l'objet sans avoir à faire de sélections individuelles (les régions qui se chevauchent ne sont pas détectées et les feuilles qui se touchent sont analysées comme un seul objet à moins que l'image ne soit modifiée).
Mesures disponibles par objet
Nombre de bouts, embranchements, croisements
Analyse des liens (moyenne globale, longueur totale et individuelle des liens, diamètre, surface, volume, bouts, couleur).
Topologie et analyse de développement (Axes, nombre et longueur des principaux et latéraux).
Nodules par objet (comptage interactif manuel, non automatique).
Comptage des semis (objets).
Superficie par classe ou groupe de couleurs.
Note: Ces mesures ne sont pas disponibles par objet uniquement pour l'image
Fractales
Données de l'histogramme de distribution des racines (longueur, surface, volume, bouts) en fonction du diamètre
Morphologie des racines (longueur, surface, ...) par couleur

Caractéristiques diverses
	Basic	Reg	Pro	Arabid
Les régions de formes rectangulaires définies par l'utilisateur peuvent être sélectionnées pour l'analyse ou exclues de celles-ci.
Les régions de formes circulaires ou irrégulières définies par l'utilisateur peuvent être sélectionnées pour l'analyse ou exclues de celles-ci.
Édition d'image pour supprimer les artefacts ou les défauts d'image. Vous pouvez choisir et modifier avec n'importe quelle couleur présente dans une image ou définir la vôtre.
Analyse interactive ou en lot (sans supervision de l'opérateur). Remarque: toutes les analyses ne peuvent pas être effectuées en lots.
Régions analysées prédéfinies. Elles permettent de créer avec une seule commande, un nombre spécifié de régions équidistantes à différentes positions verticales (profondeur du sol) dans une image. La taille et la distance entre ces régions analysées sont indiquées par l'opérateur.
Vous pouvez imprimer et enregistrer dans un fichier les images avec ou sans leurs marques d'analyse dessus.
Les débris peuvent être retirés de l'analyse dans certaines circonstances. Lorsqu'ils ne sont pas en contact avec les racines, ils peuvent être filtrés en fonction de leur surface (tout ce qui est plus petit qu'une surface indiquée est traitée comme un débris) ou de leur rapport longueur/largeur (les débris ont tendance à être ronds alors que les racines sont allongées).
Les débris peuvent également être filtrés en fonction de leur couleur.
WinRHIZO est livré avec un support technique rapide et compétent assuré par le personnel de Regent, et non par des entreprises sous-traitantes.
WinRHIZOest livré avec des manuels en couleur imprimés et pdf qui sont abondamment illustrés.

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