WinRHIZO is a complete plant root measurement and analysis systems for agricultural and forestry research.
Analyse d'Images pour la Science des Plantes
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Regent Instruments Inc. depuis 1991

 

 

WinRHIZO


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Logiciel

Le logiciel WinRHIZO est offert en 4 versions (Basic, Reg, Pro & Arabidopsis). Le tableau ci-dessous répertoire et explique les mesures et les fonctionnalités offertes par chacun.

 
WinRHIZO Basic
 
WinRHIZO Reg
 
WinRHIZO Pro
 
WinRHIZO Arabidopsis
 
 

WinRHIZO Basic est une version d'entrée de gamme à faible coût. Il ne produit que des mesures globales (diamètre moyen des racines, longueur totale des racines, surface, volume et nombre de bouts).

 

WinRHIZO Reg possède toutes les caractéristiques du modèle de base plus la mesure de la morphologie des racines en fonction des classes de diamètre définissables par l'utilisateur. Un graphique de distribution de racine (longueur, surface, volume) est généré automatiquement et est visible au-dessus de l'image.

 

WinRHIZO Pro possède toutes les fonctionnalités de la version Reg plus les analyses de liens, de topologie, d'architecture et de couleur. L'analyse de la couleur peut produire la morphologie des racines en fonction de la couleur. Il peut également être utilisé comme compteur de zone de couleur.

 

WinRHIZO Arabidopsis possède toutes les fonctionnalités de la version Pro ainsi que la possibilité de séparer et analyser séparément des objets individuels tels que les semis et les feuilles. Il peut effectuer plusieurs analyses de racines par image analysée ou par régions de celle-ci.

 

Note : Il est possible de passer d'une version de base à une version plus évoluée à tout moment en payant la différence de coût entre elles.

MESURES Basic Reg Pro Arabido Description
Morphologie des racines Longueur des racines et des segments, diamètre moyen, surface projetée, surface et volume.
Interpolation de diamètre et réglage de précision   Choisissez le niveau de précision pour la
mesure du diamètre.
Mesures et modifications
interactives (compteur manuel de nodules)
  Comptez les nodules, ajoutez des racines
manquantes ou modifiez la détection des
pointes, des croisements et des fourches.
Méthode Tennant   Longueur des racines mesurée par la
méthode statistique de Tennant.
Analyse de liens     Mesure la morphologie du segment
racinaire (entre deux fourches ou fourche et
noeud) (longueur, surface, diamètre moyen,
surface, volume…)
Topologie, ampleur, longueur du chemin, altitude, longueur du chemin externe et analyses de
développement
    Connectivité des segments racines par
ordre de croissance (principal, latéraux…),
classification topologique (EE, EI, II…) et plus
encore.
Morphologie de l'axe (longueur, surface, surface projetée et volume)     Un axe est une série de liens racines connectés du même ordre.
Fractales     Les fractales peuvent être calculées à partir
des images de racines originales (numérisées) ou détectées.
Analyse couleur     Pour la détection des racines et la
morphologie des racines (longueur, surface,
diamètre moyen, surface, volume…)
quantification par couleur. Peut également
être utilisé pour distinguer les racines de
l'arrière-plan.
Distinction, comptage et analyse d'objets distincts       Peut distinguer, compter et mesurer la
superficie, la morphologie des racines et la
couleur d’objets distincts qui ne se touchent
pas, comme de petits semis.
CARACTÉRISTIQUES Basic Reg Pro Arabido Description
Logiciel XLRhizo Pour les données produites par WinRHIZO, visualisation et analyse dans Excel.
Mesures visibles sur les images Mesures visibles sur les images.
Régions d'analyse et d'exclusion rectangulaires Choisissez la région de l'image pour
l'analyser ou l'exclure (forme rectangulaire).
Récupération des racines et sensibilité accrue   Pour détecter plus de racines (quand
elles sont pour la plupart pâles).
Réglage de la sensibilité de détection de fourche   Aide parfois l'analyse (analyses de liens, de topologie et de développement principalement).
Filtrage automatique des défauts et des débris et lissage de l'image   Basé sur di"érents critères (superficie,
morphologie et pour la version Pro couleur). Aide parfois l'analyse (analyses de liens, de topologie et de développement principalement).
Squelette de racine sur l'image de la même couleur que la classe de diamètre   Les lignes tracées sur les racines sont de
la même couleur que la classe de diamètre dans l'histogramme de distribution des racines pour indiquer leur classification locale de diamètre.
Analyse par lots   Analysez les images par lots sans la supervision d’un opérateur. Ne fonctionne pas pour les analyses de topologie et de développement.
Ensemble prédéfini de régions analysées   Créez automatiquement des régions
analysées à des positions verticales
spécifiques dans l'image.
Edition d'image   Pour supprimer des artefacts, des débris
ou des défauts, ajouter des racines manquantes ou modifier la détection des pointes, des croisements et des fourches.
Documents multiples (fenêtre de travail)   Analysez jusqu'à 16 échantillons
simultanément dans di"érentes fenêtres
principales de WinRHIZO.
Histogramme de répartition des racines en fonction du diamètre   A#che les données morphologiques des
racines (longueur, surface, volume…) en
fonction du diamètre.
Histogramme de la morphologie des racines ou de la répartition des zones colorées en fonction de la couleur     Affiche la morphologie des racines ou la
répartition des zones en fonction de la
couleur.
Régions d'exclusion de style circulaire et libre     Choisissez la région de l'image pour l'analyser ou l'exclure (forme circulaire ou irrégulière).
Détection automatique de l'arrièreplan     Pour les images acquises avec un
appareil photo lorsque l'arrière-plan ne
couvre pas la totalité de l'image.
Sauvegarde des données en option     Choisissez de sauvegarder ou non des
données plus détaillées (pour les
analyses de fractales, de liens, d'axes et
de couleurs).