WinCELL is a system for wood cell analysis
Analyse d'Images pour la Science des Plantes
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Regent Instruments Inc. depuis 1991

 

 

WinCELL

 


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Caractéristiques  

WinCELL utilise le concept de région analysée afin de rejeter les cellules incomplètes. Les cellules touchant la bordure de l'image ou situées à l'extérieur de la région analysée ne sont pas prises en compte lors du calcul des mesures moyennes des cellules (surface, longueur et largeur). La couleur utilisée pour dessiner une cellule indique sa classification: partiellement ou totalement à l'extérieur ou à l'intérieur de la région analysée, rejetée par l'opérateur, débris, type de cellule (cellule, vaisseau ou parenchyme).

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Les données de mesures sont disponibles de manière interactive lors de l'analyse et dans des fichiers texte lisibles par de nombreux logiciels. Ces fichiers sont facilement ouverts et visualisables dans des programmes de style tableur comme Microsoft Excel. Vous pouvez également cliquer sur une cellule pour afficher ses données de mesures morphologiques. L'histogramme de distribution des cellules, visible pendant l'analyse ou après dans XLCell, présente également une vue globale des paramètres de structure cellulaire. L'histogramme de distribution des cellules affiche le nombre de cellules en fonction de la surface, de la longueur ou de la largeur ainsi que la surface en fonction de la couleur.

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L'édition d'image permet de compenser les défauts ou les mauvais contrastes. Les images peuvent être éditées avec n'importe quelle couleur. Il est facile de sélectionner une couleur présente dans l'image et de la modifier. Un stylo (pour tracer des lignes) et un outil lasso (pour remplir les zones délimitées) sont fournis pour l'édition.

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Les défauts ou les régions que vous ne souhaitez pas analyser peuvent être exclus en les délimitant avec des régions d'exclusion ou en modifiant l'image. Les régions d'exclusion peuvent avoir n'importe quelle forme. Elles peuvent être utilisées dans l'analyse des cernes pour ignorer les espaces ou les zones fissurées sur du bois séché ou des carottes cassées.

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Les cellules peuvent être regroupées (comme les quatre parties de ce vaisseau) pour être analysées comme une seule.

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Caractéristiques diverses  
  • WinCELLpeut analyser les niveaux de gris ou les images couleur. Il peut utiliser le contenu de couleur pour mieux classer les pixels en lumen et paroi ou quantifier la zone en fonction de la couleur.
  • Les calibrations sont faciles à réaliser sur les cibles vendues par les fabricants de microscopes. Différents modèles de cibles sont supportés.
  • Les débris (défauts ou objets non cellulaires) peuvent être automatiquement filtrés par des caractéristiques morphologiques (surface, longueur, largeur, forme, rapport longueur sur largeur), couleur ou en éditant les images.
  • Les images originales acquises à partir de WinCELL, analysées ou non, peuvent être enregistrées dans des fichiers standard tiff ou bmp pour être ouvertes dans d'autres logiciels. Les images enregistrées avec leur analyse (dans le même fichier) sont automatiquement réanalysées lors de leur réouverture dans WinCELL (utile pour valider ou modifier une analyse effectuée précédemment).
  • Le traitement en lots est fourni pour analyser une série d'images sans la supervision d'un opérateur. Ce mode d'analyse ne fonctionne que pour les analyses qui peuvent être effectuées automatiquement (de manière non interactive).
  • Il est possible de stocker les paramètres d'analyse dans des fichiers de configuration pour les récupérer et les réutiliser ultérieurement.
  • Vous pouvez choisir quelles données sont enregistrées.
  • WinCELLpeut également être utilisé comme compteur de surface général (pour mesurer la surface foliaire par exemple) ou comme analyseur de morphologie pour d'autres objets en modifiant ses paramètres par défaut.
  • Comme tous les produits Regent, WinCELL est un logiciel autonome avec toutes les fonctionnalités nécessaires intégrées. Il ne nécessite pas de logiciel d'analyse d'image complexe supplémentaire ni de compétences en programmation comme dans certains autres logiciels d'analyse de cellules.
CARACTÉRISTIQUES Basic Reg Pro Description
Logiciel XLCell Pour la visualisation et l'analyse dans Excel des données produites par WinCELL.
Filtrage automatique des défauts et débris √* √* Basé sur différents critères (superficie, morphologie et pour la version Pro couleur).
* = plus d'options
Mesures visibles sur les images Les lignes indiquent où et comment la longueur, la largeur, le périmètre… ont été mesurés.
Corrections peuvent être effectuées par l'opérateur. Des corrections peuvent être effectuées par l'opérateur.
Régions d'analyse et d'exclusion de forme rectangulaire. Choisissez la région de l'image à analyser ou à exclure
(forme rectangulaire).
Régions d'analyse et d'exclusion de forme circulaire ou irrégulière Choisissez la région de l'image pour l'analyser ou l'exclure (forme circulaire ou irrégulière).
Analyse en lots   Analysez les images en lots sans la supervision d’un
opérateur.
Édition d'images   Supprime les artefacts, débris, défauts ou modifie le lumen détecté.
Multiple documents   Analysez jusqu'à 16 échantillons simultanément dans
différentes fenêtres principales de WinCELL.
Seuil de cerne   Pour une meilleure détection des lumières, l'intensité du seuil est modifiée en fonction de la position sur le cerne pour tenir compte des lumières plus sombres.
Regroupement de cellules   Pour lorsque les vaisseaux sont divisés en deux lumen ou plus par les murs. Ils seront regroupés et mesurés comme
un seul lumen.
Enregistrer les données au format WinDENDRO   Facultatif, pour l’analyse des cernes annuels.
Histogramme de la distribution
des cellules
  Affiche la répartition des cellules en fonction de différentes
données morphologiques (surface, longueur, largeur…).
Histogramme de répartition des
zones de couleur
    Affiche la répartition des zones en fonction de la couleur.
Compensation des inégalités de
fond
    Supprime la non-uniformité de l'éclairage (attention : il est
préférable de le faire avant l'acquisition de l'image).